قانون جدید نروژ دانشجویان دکتری و پسا‌دکتری بین‌المللی را ملزم به یادگیری زبان نروژی می‌کند تا از غلبه انگلیسی بر آموزش عالی جلوگیری شود.
این اقدام با هدف حفظ زبان نروژی به عنوان زبان علمی صورت گرفته، اما منتقدان معتقدند که این قانون می‌تواند جذابیت نروژ را برای استعدادهای برتر کاهش داده و جذب اعضای هیئت علمی را دشوار کند.
مشابه این سیاست در هلند نیز دیده می‌شود، جایی که دولت قصد دارد دوره‌های کارشناسی انگلیسی را محدود کند. برخی این اقدامات را بخشی از روند حمایت‌گرایی در اروپا می‌دانند، اما این سؤال مطرح است که چرا باید در برابر پژوهشگران و نیروی کار متخصص از خود محافظت کنیم؟
این اقدام با هدف حفظ زبان نروژی به عنوان زبان علمی صورت گرفته، اما منتقدان معتقدند که این قانون می‌تواند جذابیت نروژ را برای استعدادهای برتر کاهش داده و جذب اعضای هیئت علمی را دشوار کند.
مشابه این سیاست در هلند نیز دیده می‌شود، جایی که دولت قصد دارد دوره‌های کارشناسی انگلیسی را محدود کند. برخی این اقدامات را بخشی از روند حمایت‌گرایی در اروپا می‌دانند، اما این سؤال مطرح است که چرا باید در برابر پژوهشگران و نیروی کار متخصص از خود محافظت کنیم؟
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
زیر سقف خیال_همایون شجریان
@homayoonshajarian2
«زیر سقف خیال»
خواننده: همایون شجریان
آهنگ: فردین خلعتبری
شعر: افشین یداللهی
بوسه‌هایت مسیر معراج است
زیر سقف خیال و خلوت و خشت
با تو گویی خدا مرا آرام
می‌برد روی دوش خود به بهشت
«زیر سقف خیال»
خواننده: همایون شجریان
آهنگ: فردین خلعتبری
شعر: افشین یداللهی
بوسه‌هایت مسیر معراج است
زیر سقف خیال و خلوت و خشت
با تو گویی خدا مرا آرام
می‌برد روی دوش خود به بهشت
دانشمندان در EPFL سوئیس و شرکت Flowbone یک هیدروژل تزریقی نوآورانه برای درمان پوکی استخوان توسعه داده‌اند. این ژل از اسید هیالورونیک و نانوذرات هیدروکسی‌آپاتیت ساخته شده و ترکیب طبیعی استخوان را شبیه‌سازی می‌کند تا بخش‌های ضعیف را تقویت کند. آزمایش‌ها روی موش‌ها نشان داد که این هیدروژل می‌تواند چگالی استخوان را تا سه برابر افزایش دهد و در ترکیب با داروی زولدرونات، این افزایش به پنج برابر می‌رسد. اگرچه این روش درمان قطعی نیست، اما می‌تواند در کنار داروهای موجود به تسریع بهبود و کاهش خطر شکستگی کمک کند. اکنون محققان در حال تلاش برای دریافت مجوزهای قانونی و آغاز آزمایش‌های انسانی هستند که در صورت موفقیت، می‌تواند تحول بزرگی در درمان پوکی استخوان ایجاد کند.
روش SDS-PAGE یک تکنیک استاندارد برای جداسازی پروتئین‌ها بر اساس وزن مولکولی است. در این روش، پروتئین‌ها با بافر SDS واسرشت شده و بار منفی یکنواخت می‌گیرند، سپس در یک ژل پلی‌آکریل‌آمید تحت میدان الکتریکی مهاجرت می‌کنند.
سرعت حرکت پروتئین‌ها به وزن مولکولی آن‌ها بستگی دارد، به طوری که پروتئین‌های کوچکتر سریع‌تر حرکت می‌کنند
. رنگ‌آمیزی با کوماسی بریلیانت بلو امکان مشاهده باندهای پروتئینی را فراهم می‌کند که برای تحلیل خلوص، شناسایی تخریب و تخمین وزن مولکولی استفاده می‌شود.
سرعت حرکت پروتئین‌ها به وزن مولکولی آن‌ها بستگی دارد، به طوری که پروتئین‌های کوچکتر سریع‌تر حرکت می‌کنند
. رنگ‌آمیزی با کوماسی بریلیانت بلو امکان مشاهده باندهای پروتئینی را فراهم می‌کند که برای تحلیل خلوص، شناسایی تخریب و تخمین وزن مولکولی استفاده می‌شود.
نانودراپ یک نوع اسپکتروفتومتر است که امکان اندازه‌گیری دقیق و سریع اسیدهای نوکلئیک و پروتئین‌ها را تنها با ۱-۲ میکرولیتر نمونه فراهم می‌کند.
این دستگاه با دامنه دینامیکی وسیع (تا ۱۵,۰۰۰ نانوگرم بر میکرولیتر برای dsDNA) نیاز به رقیق‌سازی را کاهش می‌دهد و از فناوری بدون کووت برای آنالیز مستقیم نمونه روی سکوی کوچک فلزی یا pedestal بهره می‌برد.
رابط کاربری لمسی و نرم‌افزار داخلی، پردازش داده‌ها را تسریع می‌کند و الگوریتم‌های شناسایی آلودگی کیفیت نمونه‌ها را ارزیابی می‌کنند.
نانودراپ در تحقیقات ژنتیکی، qPCR، تعیین غلظت پروتئین، آماده‌سازی نمونه‌های NGS و تشخیص‌های بالینی نقش کلیدی دارد و با افزایش دقت، بازتولیدپذیری و کارایی، بهینه‌سازی فرایندهای زیستی را تسهیل می‌کند.
این دستگاه با دامنه دینامیکی وسیع (تا ۱۵,۰۰۰ نانوگرم بر میکرولیتر برای dsDNA) نیاز به رقیق‌سازی را کاهش می‌دهد و از فناوری بدون کووت برای آنالیز مستقیم نمونه روی سکوی کوچک فلزی یا pedestal بهره می‌برد.
رابط کاربری لمسی و نرم‌افزار داخلی، پردازش داده‌ها را تسریع می‌کند و الگوریتم‌های شناسایی آلودگی کیفیت نمونه‌ها را ارزیابی می‌کنند.
نانودراپ در تحقیقات ژنتیکی، qPCR، تعیین غلظت پروتئین، آماده‌سازی نمونه‌های NGS و تشخیص‌های بالینی نقش کلیدی دارد و با افزایش دقت، بازتولیدپذیری و کارایی، بهینه‌سازی فرایندهای زیستی را تسهیل می‌کند.
واکنش های PCR، qPCR، RT-PCR و RT-qPCR همگی بر پایه واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) هستند و تفاوت آن‌ها در کاربرد و نوع هدف شناسایی است.
روش PCR استاندارد برای تکثیر و شناسایی DNA با سه مرحله واسرشته سازی(۹۵درجه)، اتصال پرایمرها (۵۵-۶۰درجه) و بسط(۷۲درجه) انجام می‌شود.
روش qPCR (PCR کمی) با استفاده از اغازگر فلورسانس میزان DNA یا cDNA را به‌صورت کمی و در زمان واقعی اندازه‌گیری می‌کند.
روش RT-PCR ابتدا RNA را به cDNA تبدیل کرده و سپس با روش PCR تکثیر می‌کند. RT-qPCR ترکیبی از RT-PCR و qPCR است که برای آنالیز کمی RNA، مطالعات بیان ژن و تشخیص بار ویروسی کاربرد دارد.
روش PCR استاندارد برای تکثیر و شناسایی DNA با سه مرحله واسرشته سازی(۹۵درجه)، اتصال پرایمرها (۵۵-۶۰درجه) و بسط(۷۲درجه) انجام می‌شود.
روش qPCR (PCR کمی) با استفاده از اغازگر فلورسانس میزان DNA یا cDNA را به‌صورت کمی و در زمان واقعی اندازه‌گیری می‌کند.
روش RT-PCR ابتدا RNA را به cDNA تبدیل کرده و سپس با روش PCR تکثیر می‌کند. RT-qPCR ترکیبی از RT-PCR و qPCR است که برای آنالیز کمی RNA، مطالعات بیان ژن و تشخیص بار ویروسی کاربرد دارد.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
پروتئین nine-haem cytochrome c از Desulfovibrio desulfuricans یک متالوپروتئین پیچیده است که نقش کلیدی در انتقال الکترون در شرایط بی‌هوازی دارد و برای تولید انرژی از طریق احیای سولفات ضروری است.
این پروتئین دارای نه گروه هِم متصل به‌صورت کووالانسی است که با بقایای هیستیدین هماهنگ شده‌اند و یک شبکه فشرده برای انتقال کارآمد الکترون ایجاد می‌کنند.
آهن موجود در هر هم بین Fe(II) (احیاشده) و Fe(III) (اکسیدشده) تغییر می‌کند و به دلیل سازمان‌دهی منظم، انتقال الکترون با حداقل مانع انرژی انجام می‌شود.
پتانسیل ردوکس متغیر بین هم‌ها باعث ایجاد شیب تدریجی انتقال الکترون شده و از واکنش‌های برگشتی و نشت الکترون جلوگیری می‌کند، که این ویژگی برای بقای این باکتری در محیط‌های کم‌انرژی بی‌هوازی بسیار مهم است
این پروتئین دارای نه گروه هِم متصل به‌صورت کووالانسی است که با بقایای هیستیدین هماهنگ شده‌اند و یک شبکه فشرده برای انتقال کارآمد الکترون ایجاد می‌کنند.
آهن موجود در هر هم بین Fe(II) (احیاشده) و Fe(III) (اکسیدشده) تغییر می‌کند و به دلیل سازمان‌دهی منظم، انتقال الکترون با حداقل مانع انرژی انجام می‌شود.
پتانسیل ردوکس متغیر بین هم‌ها باعث ایجاد شیب تدریجی انتقال الکترون شده و از واکنش‌های برگشتی و نشت الکترون جلوگیری می‌کند، که این ویژگی برای بقای این باکتری در محیط‌های کم‌انرژی بی‌هوازی بسیار مهم است
در چنین روزی در سال ۱۹۲۸، سِر چاندراسخارا ونکاتا رامان اثر رامان (برنده نوبل 1930 فیزیک) را کشف کرد.
اثر رامان به تغییر در طول موج نور هنگام پراکندگی آن توسط مولکول‌ها گفته می‌شود. این پدیده که به نام فیزیکدان هندی نام‌گذاری شده است، نتیجه آزمایش‌هایی روی پراکندگی نور بود.
زمانی که نور به ذراتی کوچکتر از طول موج خود برخورد می‌کند، در جهات مختلف پراکنده می‌شود؛ مانند زمانی که فوتون‌ها با مولکول‌های یک گاز برخورد می‌کنند.
رامان کشف کرد که بخشی از نور پراکنده‌شده طول موجی متفاوت از نور اصلی دارد. دلیل این امر آن است که بخشی از انرژی فوتون‌های ورودی به مولکول منتقل می‌شود و سطح انرژی آن را افزایش می‌دهد.
اثر رامان به تغییر در طول موج نور هنگام پراکندگی آن توسط مولکول‌ها گفته می‌شود. این پدیده که به نام فیزیکدان هندی نام‌گذاری شده است، نتیجه آزمایش‌هایی روی پراکندگی نور بود.
زمانی که نور به ذراتی کوچکتر از طول موج خود برخورد می‌کند، در جهات مختلف پراکنده می‌شود؛ مانند زمانی که فوتون‌ها با مولکول‌های یک گاز برخورد می‌کنند.
رامان کشف کرد که بخشی از نور پراکنده‌شده طول موجی متفاوت از نور اصلی دارد. دلیل این امر آن است که بخشی از انرژی فوتون‌های ورودی به مولکول منتقل می‌شود و سطح انرژی آن را افزایش می‌دهد.
آیا می‌خواهید بیشتر در مورد مدل‌های زبانی بزرگ (LLMs) در بیولوژی، به‌ویژه در زمینه ژنومیک بدانید؟
در این لینک یک آموزش عملی برای استفاده از LLMs در DNA توسعه داده شده است که شامل کاربردهای مختلفی مانند پیش‌آموزش مدل‌های LLM، تنظیم دقیق برای طبقه‌بندی توالی‌های DNA، پیش‌بینی جهش‌ها با استفاده از یادگیری بدون نیاز به آموزش قبلی (zero-shot)، تولید توالی‌های مصنوعی DNA و بهینه‌سازی توالی‌های DNA است.
این آموزش‌ها بر اساس Google Colab است، بنابراین همه می‌توانند این نوت‌بوک‌ها را اجرا کنند
در این لینک یک آموزش عملی برای استفاده از LLMs در DNA توسعه داده شده است که شامل کاربردهای مختلفی مانند پیش‌آموزش مدل‌های LLM، تنظیم دقیق برای طبقه‌بندی توالی‌های DNA، پیش‌بینی جهش‌ها با استفاده از یادگیری بدون نیاز به آموزش قبلی (zero-shot)، تولید توالی‌های مصنوعی DNA و بهینه‌سازی توالی‌های DNA است.
این آموزش‌ها بر اساس Google Colab است، بنابراین همه می‌توانند این نوت‌بوک‌ها را اجرا کنند
اصول رسم نمودارها در بسته ggplot2 در R
بخش اول: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
تمام نمودارهای ggplot2 با فراخوانی تابع ggplot آغاز می‌شوند که داده‌های پیش‌فرض و نگاشت‌های زیبایی‌شناسی را که با aes مشخص می‌شوند، تأمین می‌کند. سپس با استفاده از علامت + لایه‌ها، مقیاس‌ها، مختصات و فست‌ها به آن افزوده می‌شوند. برای ذخیره یک نمودار در مسیر دلخواه بر روی سیستم شما از تابع ggsave استفاده می‌شود.
ggplot()
ایجاد یک ggplot جدید
aes()
ساخت نگاشت‌های زیبایی‌شناسی
+ (<gg>) %+%
افزودن اجزا به یک نمودار
ggsave()
ذخیره یک ggplot (یا هر شیء دیگر از نوع grid) با تنظیمات پیش‌فرض معقول و همچنین کد زیر برای رسم سریع نمودارها بدون اضافه کردن توضیحات و لایه بندی کد R
qplot() quickplot()
بخش اول: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
تمام نمودارهای ggplot2 با فراخوانی تابع ggplot آغاز می‌شوند که داده‌های پیش‌فرض و نگاشت‌های زیبایی‌شناسی را که با aes مشخص می‌شوند، تأمین می‌کند. سپس با استفاده از علامت + لایه‌ها، مقیاس‌ها، مختصات و فست‌ها به آن افزوده می‌شوند. برای ذخیره یک نمودار در مسیر دلخواه بر روی سیستم شما از تابع ggsave استفاده می‌شود.
ggplot()
ایجاد یک ggplot جدید
aes()
ساخت نگاشت‌های زیبایی‌شناسی
+ (<gg>) %+%
افزودن اجزا به یک نمودار
ggsave()
ذخیره یک ggplot (یا هر شیء دیگر از نوع grid) با تنظیمات پیش‌فرض معقول و همچنین کد زیر برای رسم سریع نمودارها بدون اضافه کردن توضیحات و لایه بندی کد R
qplot() quickplot()