vmd-2.0.0a4.bin.LINUXAMD64.tar.gz
65 MB
فایل سورس نرم افزار Vmd2 نسخه آلفا 4
این نسخه از نرم افزار vmd فقط بر روی لینوکس قابل نصب است و برای سیستم عامل مک و ویندوز هنوز سازنده نسخه جدیدی ارائه نشده است. امروز پس از انتشار این نسخه توسط تیم ادمین کانال کیفیت نرم افزار و نصب و اجرای آن صحت سنجی شد و در اختیار شما عزیزان در این فایل قرار می گیرد. می توانید فایل را به صورت مستقیم در مسیر /home/قرار دهید و سپس آن را از حالت فشرده خارج، کانفیگیور و با دستور make نصب کنید و برای کارهای خود استفاده نمایید. در نسخه جدید اینترفیس اجرای NAMD در داخل نرم افزار هم بهبود یافته است و مراحل کار با آن ساده شده است و برای شبیه سازی دینامیک مولکولی خود می توانید از آن بهره ببرید.
این نسخه از نرم افزار vmd فقط بر روی لینوکس قابل نصب است و برای سیستم عامل مک و ویندوز هنوز سازنده نسخه جدیدی ارائه نشده است. امروز پس از انتشار این نسخه توسط تیم ادمین کانال کیفیت نرم افزار و نصب و اجرای آن صحت سنجی شد و در اختیار شما عزیزان در این فایل قرار می گیرد. می توانید فایل را به صورت مستقیم در مسیر /home/قرار دهید و سپس آن را از حالت فشرده خارج، کانفیگیور و با دستور make نصب کنید و برای کارهای خود استفاده نمایید. در نسخه جدید اینترفیس اجرای NAMD در داخل نرم افزار هم بهبود یافته است و مراحل کار با آن ساده شده است و برای شبیه سازی دینامیک مولکولی خود می توانید از آن بهره ببرید.
خواستم یاداوری کنم ما همون طبقه متوسطی بودیم که بعد از خرید ماشین، گوسفند قربونی میکردیم.
الان ماشین که هیچ، گوسفندم نمی شه خرید…😂
الان ماشین که هیچ، گوسفندم نمی شه خرید…😂
سرطان‌های پروستات مقاوم به آندروژن که با تهاجم بالا و پیش‌آگهی بد همراه هستند، به‌دلیل جهش‌ها یا حذف‌هایی در گیرنده آندروژن (AR) یا بیان نسخه‌های کوتاه‌شده فعال AR ایجاد می‌شوند.
داروهای فعلی که بر گیرنده آندروژن هدف‌گذاری می‌کنند، به‌طور معمول قادر به دسترسی به نسخه‌های کوتاه‌شده مانند AR-V7 که تنها دامنه اتصال به DNA را دارند و دامنه اتصال به لیگاند را از دست داده‌اند، نیستند.
در این مطالعه، با استفاده از یک کتابخانه لیگاند واکنشی حاوی سیستئین در یک اسکرین سلولی، مولکولی به نام EN1441 شناسایی شد که به‌طور انتخابی AR و AR-V7 را از طریق هدف‌گیری کووالانسی سیستئین C125 در این گیرنده‌ها تخریب می‌کند
داروهای فعلی که بر گیرنده آندروژن هدف‌گذاری می‌کنند، به‌طور معمول قادر به دسترسی به نسخه‌های کوتاه‌شده مانند AR-V7 که تنها دامنه اتصال به DNA را دارند و دامنه اتصال به لیگاند را از دست داده‌اند، نیستند.
در این مطالعه، با استفاده از یک کتابخانه لیگاند واکنشی حاوی سیستئین در یک اسکرین سلولی، مولکولی به نام EN1441 شناسایی شد که به‌طور انتخابی AR و AR-V7 را از طریق هدف‌گیری کووالانسی سیستئین C125 در این گیرنده‌ها تخریب می‌کند
شرکت NVIDIA از هوش مصنوعی جدید خود به نام EVO2 رونمایی کرد.
مؤسسه Arc با همکاری NVIDIA مدل هوش مصنوعی Evo 2 را توسعه داده است که بر روی DNA بیش از 128,000 گونه از سراسر درخت زندگی آموزش دیده است.
این مدل می‌تواند جهش‌های مرتبط با بیماری را با دقت بیش از ۹۰٪ شناسایی کند و ژنوم‌های جدیدی به اندازه ژنوم باکتری‌ها طراحی نماید. Evo 2 که از معماری جدید StripedHyena 2 بهره می‌برد، قادر است تا یک میلیون نوکلئوتید را به‌طور همزمان پردازش کند.
این مدل به‌صورت متن‌باز منتشر شده و از طریق GitHub و پلتفرم NVIDIA BioNeMo در دسترس است. توسعه‌دهندگان امیدوارند که این مدل به کشف علل ژنتیکی بیماری‌ها و طراحی درمان‌های هدفمندتر کمک کند.
مؤسسه Arc با همکاری NVIDIA مدل هوش مصنوعی Evo 2 را توسعه داده است که بر روی DNA بیش از 128,000 گونه از سراسر درخت زندگی آموزش دیده است.
این مدل می‌تواند جهش‌های مرتبط با بیماری را با دقت بیش از ۹۰٪ شناسایی کند و ژنوم‌های جدیدی به اندازه ژنوم باکتری‌ها طراحی نماید. Evo 2 که از معماری جدید StripedHyena 2 بهره می‌برد، قادر است تا یک میلیون نوکلئوتید را به‌طور همزمان پردازش کند.
این مدل به‌صورت متن‌باز منتشر شده و از طریق GitHub و پلتفرم NVIDIA BioNeMo در دسترس است. توسعه‌دهندگان امیدوارند که این مدل به کشف علل ژنتیکی بیماری‌ها و طراحی درمان‌های هدفمندتر کمک کند.
ژنوم و پروتئین‌های SARS-CoV-2
ژنوم SARS-CoV-2 یک رشته‌ی منفرد از RNA است که مجموعه‌ای گسترده از پروتئین‌ها را کدگذاری می‌کند. این پروتئین‌ها پس از آلوده کردن یک سلول میزبان، توسط دستگاه ریبوزومی سنتز می‌شوند.
توالی ژنومی SARS-CoV-2 در تاریخ ۱۰ ژانویه ۲۰۲۰ به‌صورت عمومی منتشر شد و در ۵ فوریه ۲۰۲۰، اولین ساختار تعیین‌شده‌ی تجربی از این ویروس – پروتئین اصلی پروتئاز – در پایگاه داده‌ی ساختار پروتئینی (PDB) ثبت گردید. از آن زمان، تعداد ساختارهای SARS-CoV-2 در PDB به‌صورت نمایی افزایش یافته است.
این تصویر نمونه‌هایی از پروتئین‌های SARS-CoV-2 موجود در PDB و مدل‌هایی را که بر اساس اطلاعات ژنومی و سایر داده‌های ساختاری در دسترس توسعه یافته‌اند، ارائه می‌دهد.
ژنوم SARS-CoV-2 یک رشته‌ی منفرد از RNA است که مجموعه‌ای گسترده از پروتئین‌ها را کدگذاری می‌کند. این پروتئین‌ها پس از آلوده کردن یک سلول میزبان، توسط دستگاه ریبوزومی سنتز می‌شوند.
توالی ژنومی SARS-CoV-2 در تاریخ ۱۰ ژانویه ۲۰۲۰ به‌صورت عمومی منتشر شد و در ۵ فوریه ۲۰۲۰، اولین ساختار تعیین‌شده‌ی تجربی از این ویروس – پروتئین اصلی پروتئاز – در پایگاه داده‌ی ساختار پروتئینی (PDB) ثبت گردید. از آن زمان، تعداد ساختارهای SARS-CoV-2 در PDB به‌صورت نمایی افزایش یافته است.
این تصویر نمونه‌هایی از پروتئین‌های SARS-CoV-2 موجود در PDB و مدل‌هایی را که بر اساس اطلاعات ژنومی و سایر داده‌های ساختاری در دسترس توسعه یافته‌اند، ارائه می‌دهد.
این تصویر ادغام ویروس SARS-CoV-2 (به رنگ سرخابی) با غشای اندوزومی (به رنگ سبز) را نشان می‌دهد، که طی آن، ژنوم RNA ویروسی در سیتوپلاسم سلول (به رنگ آبی) آزاد می‌شود.
در این مرحله، ژنوم RNA ویروس شروع به ترجمه توسط ریبوزوم‌های سلولی می‌کند تا پلی‌پروتئین‌های ویروسی را بسازد. این نقاشی شامل عناصر فرضی است که برای برجسته کردن این فرآیند طراحی شده‌اند؛ به‌ویژه، چندین حالت از پروتئین اسپایک ویروس به تصویر کشیده شده است.
....بیشتر بدانید...
در این مرحله، ژنوم RNA ویروس شروع به ترجمه توسط ریبوزوم‌های سلولی می‌کند تا پلی‌پروتئین‌های ویروسی را بسازد. این نقاشی شامل عناصر فرضی است که برای برجسته کردن این فرآیند طراحی شده‌اند؛ به‌ویژه، چندین حالت از پروتئین اسپایک ویروس به تصویر کشیده شده است.
....بیشتر بدانید...
Booye Baroon {webahang.ir}
MohammadReza Shajarian
بوی باران بوی سبزه بوی خاک
شاخه های شسته باران خورده پاک
آسمان آبی وابر سپید برگ های سبز بید
عطر نرگس رقص باد نغمه شوق پرستوهای شاد
خلوت گرم کبوترهای مست
نرم نرمک میرسد اینک بهار...
شاخه های شسته باران خورده پاک
آسمان آبی وابر سپید برگ های سبز بید
عطر نرگس رقص باد نغمه شوق پرستوهای شاد
خلوت گرم کبوترهای مست
نرم نرمک میرسد اینک بهار...
پاپیلوماویروس یک ویروس کوچک است که دارای یک کپسید ساده و یک ژنوم حلقوی از DNA دو رشته ای می‌باشد. این کپسید شامل ۳۶۰ نسخه از زنجیره اصلی کپسید به نام L1 است.
یک زنجیره دیگر درون کپسید به نام L2 نیز وجود دارد که ممکن است در بسته‌بندی ژنوم نقش داشته باشد. ساختار کپسید این ویروس، برخلاف بسیاری از ویروس‌های دارای تقارن شبه‌منظم، متفاوت است.
در عوض، مانند ویروس SV40، زنجیره‌های L1 ۷۲ کپسومر پنج‌تایی را تشکیل می‌دهند که از طریق دُم‌های بلند و انعطاف‌پذیر با یکدیگر تعامل دارند. این ویروس‌ها به سلول‌های پوست و غشاهای مخاطی ما حمله می‌کنند. هنگام آلوده کردن سلول‌ها، عملکردهای رشد طبیعی را افزایش داده و اغلب موجب تشکیل زگیل می‌شوند.
یک زنجیره دیگر درون کپسید به نام L2 نیز وجود دارد که ممکن است در بسته‌بندی ژنوم نقش داشته باشد. ساختار کپسید این ویروس، برخلاف بسیاری از ویروس‌های دارای تقارن شبه‌منظم، متفاوت است.
در عوض، مانند ویروس SV40، زنجیره‌های L1 ۷۲ کپسومر پنج‌تایی را تشکیل می‌دهند که از طریق دُم‌های بلند و انعطاف‌پذیر با یکدیگر تعامل دارند. این ویروس‌ها به سلول‌های پوست و غشاهای مخاطی ما حمله می‌کنند. هنگام آلوده کردن سلول‌ها، عملکردهای رشد طبیعی را افزایش داده و اغلب موجب تشکیل زگیل می‌شوند.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
شکوفایی تمدن بشر، برآیند ایده های مهندسین تلاشگر است.
پنجم اسفند روز مهندس بر شما مبارک
پنجم اسفند روز مهندس بر شما مبارک
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM