معرفی Samtools نسخه 21-1
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران.
ابزار Samtools یک مجموعه ابزار برای پردازش، تجزیهوتحلیل و مدیریت فایلهای SAM, BAM و CRAM در پردازش داده های NGS استفاده می شود.
این ابزار برای مرتبسازی، فیلتر کردن، تبدیل فرمت، جستجوی همردیفیها و نمایهسازی (indexing) فایلهای توالییابی استفاده میشود.
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران.
ابزار Samtools یک مجموعه ابزار برای پردازش، تجزیهوتحلیل و مدیریت فایلهای SAM, BAM و CRAM در پردازش داده های NGS استفاده می شود.
این ابزار برای مرتبسازی، فیلتر کردن، تبدیل فرمت، جستجوی همردیفیها و نمایهسازی (indexing) فایلهای توالییابی استفاده میشود.
# نصب کلاسیک:
$ wget https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.21/samtools-1.21.tar.bz2
$ bunzip2 samtools-1.21.tar.bz2
$ tar -xvf samtools-1.21.tar
$ cd samtools-1.21
$ make
$ ./samtools
#نصب آسان و کم دردسر (پیشنهادی ما):
$ conda install bioconda::samtools
👍4🥰1
tgoop.com/IRBioinformatics/2143
Create:
Last Update:
Last Update:
معرفی Samtools نسخه 21-1
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران.
ابزار Samtools یک مجموعه ابزار برای پردازش، تجزیهوتحلیل و مدیریت فایلهای SAM, BAM و CRAM در پردازش داده های NGS استفاده می شود.
این ابزار برای مرتبسازی، فیلتر کردن، تبدیل فرمت، جستجوی همردیفیها و نمایهسازی (indexing) فایلهای توالییابی استفاده میشود.
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران.
ابزار Samtools یک مجموعه ابزار برای پردازش، تجزیهوتحلیل و مدیریت فایلهای SAM, BAM و CRAM در پردازش داده های NGS استفاده می شود.
این ابزار برای مرتبسازی، فیلتر کردن، تبدیل فرمت، جستجوی همردیفیها و نمایهسازی (indexing) فایلهای توالییابی استفاده میشود.
# نصب کلاسیک:
$ wget https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.21/samtools-1.21.tar.bz2
$ bunzip2 samtools-1.21.tar.bz2
$ tar -xvf samtools-1.21.tar
$ cd samtools-1.21
$ make
$ ./samtools
#نصب آسان و کم دردسر (پیشنهادی ما):
$ conda install bioconda::samtools
BY آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی




Share with your friend now:
tgoop.com/IRBioinformatics/2143