معرفی ابزار iSeqQC
کنترل کیفیت در هر فناوری توالییابی با توان بالا (high-throughput sequencing) یک گام حیاتی است که اگر نادیده گرفته شود، میتواند به یک آزمایش و نتایج حاصل از آن آسیب برساند.
روشهای متعددی برای شناسایی سوگیریها در طول توالییابی یا همترازی (alignment) وجود دارد، اما ابزارهای کمی برای تفسیر سوگیریهای ناشی از دادههای پرت (outliers) وجود دارد. ابزار iSeqQC یک ابزار کنترل کیفیت (QC) سریع و سبک مبتنی بر بیان ژن است که با استفاده از روشهای آماری مختلف، دادههای پرت را شناسایی میکند و کیفیت داده های شما را مشخص می کند.
این ابزار به صورت رایگان در دسترس است و می توانید با نصب آن به عنوان یک ماژول در نرم افزار R از آن برای کنترل کیفی داده های RNAseq خود استفاده نمایید. برای دانلود بر روی لینک زیر کلیک کنید
کنترل کیفیت در هر فناوری توالییابی با توان بالا (high-throughput sequencing) یک گام حیاتی است که اگر نادیده گرفته شود، میتواند به یک آزمایش و نتایج حاصل از آن آسیب برساند.
روشهای متعددی برای شناسایی سوگیریها در طول توالییابی یا همترازی (alignment) وجود دارد، اما ابزارهای کمی برای تفسیر سوگیریهای ناشی از دادههای پرت (outliers) وجود دارد. ابزار iSeqQC یک ابزار کنترل کیفیت (QC) سریع و سبک مبتنی بر بیان ژن است که با استفاده از روشهای آماری مختلف، دادههای پرت را شناسایی میکند و کیفیت داده های شما را مشخص می کند.
این ابزار به صورت رایگان در دسترس است و می توانید با نصب آن به عنوان یک ماژول در نرم افزار R از آن برای کنترل کیفی داده های RNAseq خود استفاده نمایید. برای دانلود بر روی لینک زیر کلیک کنید
iSeqQC: An Expression based Quality Control tool
دانلود مستقیم کدهای منبع این بسته نرم افزاری R
👍5❤1🔥1
tgoop.com/IRBioinformatics/1843
Create:
Last Update:
Last Update:
معرفی ابزار iSeqQC
کنترل کیفیت در هر فناوری توالییابی با توان بالا (high-throughput sequencing) یک گام حیاتی است که اگر نادیده گرفته شود، میتواند به یک آزمایش و نتایج حاصل از آن آسیب برساند.
روشهای متعددی برای شناسایی سوگیریها در طول توالییابی یا همترازی (alignment) وجود دارد، اما ابزارهای کمی برای تفسیر سوگیریهای ناشی از دادههای پرت (outliers) وجود دارد. ابزار iSeqQC یک ابزار کنترل کیفیت (QC) سریع و سبک مبتنی بر بیان ژن است که با استفاده از روشهای آماری مختلف، دادههای پرت را شناسایی میکند و کیفیت داده های شما را مشخص می کند.
این ابزار به صورت رایگان در دسترس است و می توانید با نصب آن به عنوان یک ماژول در نرم افزار R از آن برای کنترل کیفی داده های RNAseq خود استفاده نمایید. برای دانلود بر روی لینک زیر کلیک کنید
کنترل کیفیت در هر فناوری توالییابی با توان بالا (high-throughput sequencing) یک گام حیاتی است که اگر نادیده گرفته شود، میتواند به یک آزمایش و نتایج حاصل از آن آسیب برساند.
روشهای متعددی برای شناسایی سوگیریها در طول توالییابی یا همترازی (alignment) وجود دارد، اما ابزارهای کمی برای تفسیر سوگیریهای ناشی از دادههای پرت (outliers) وجود دارد. ابزار iSeqQC یک ابزار کنترل کیفیت (QC) سریع و سبک مبتنی بر بیان ژن است که با استفاده از روشهای آماری مختلف، دادههای پرت را شناسایی میکند و کیفیت داده های شما را مشخص می کند.
این ابزار به صورت رایگان در دسترس است و می توانید با نصب آن به عنوان یک ماژول در نرم افزار R از آن برای کنترل کیفی داده های RNAseq خود استفاده نمایید. برای دانلود بر روی لینک زیر کلیک کنید
iSeqQC: An Expression based Quality Control tool
دانلود مستقیم کدهای منبع این بسته نرم افزاری R
BY آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی


Share with your friend now:
tgoop.com/IRBioinformatics/1843