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空间转录组学揭示人类大脑皮层层次与区域的特异化
Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area specification

https://www.nature.com/articles/s41586-025-09010-1

Xuyu Qian, Kyle Coleman, Shunzhou Jiang, Andrea J. Kriz, Jack H. Marciano, Chunyu Luo, Chunhui Cai, Monica Devi Manam, Emre Caglayan, Abbe Lai, David Exposito-Alonso, Aoi Otani, Urmi Ghosh, Diane D. Shao, Rebecca E. Andersen, Jennifer E. Neil, Robert Johnson, Alexandra LeFevre, Jonathan L. Hecht, Nicola Micali, Nenad Sestan, Pasko Rakic, Michael B. Miller, Liang Sun, …Christopher A. Walsh

人类大脑皮层由六个层次和数十个在分子与结构上各具特色的区域构成。尽管单细胞转录组学推动了对皮层发育的分子解析,细胞解离过程中丢失空间背景仍留下重要空白。本研究结合多重误差稳健荧光原位杂交(MERFISH)及深度学习核分割技术,在单细胞空间分辨率下系统描绘了人胎脑皮层的分子、细胞及细胞构筑学发育图谱。该图谱涵盖七个发育阶段、八个皮层区域,总计超过一千八百万个单细胞。

我们发现:在传统细胞构筑学层可见前约三个月,六层结构便已通过兴奋性神经元亚型的层状分布而提前建立。中期妊娠期呈现两种皮层区域特化模式:(1)大多数区域沿前-后轴呈连续渐变;(2)初级(V1)与次级(V2)视觉皮层之间则出现离散、突变式边界,最早可追溯至妊娠第20周。V1–V2 神经元亚型的截然二元分布挑战了“中期妊娠皮层区域化仅是梯度过渡”的传统观点。进一步将单核 RNA 测序与 MERFISH 融合分析揭示,V1 特异性第 4 层神经元早期即上调了突触发生相关基因。

综上,空间关系在决定皮层层次与区域的分子特征中起关键作用。本研究确立了空间分辨单细胞分析范式,为构建人脑发育的综合图谱奠定了基础。

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我用1800万个细胞,破解了人类大脑诞生的时空谜题
UP: 女神绫波丽
https://www.bilibili.com/video/BV17s3WzCEQ2

大脑皮层是人脑中最关键、最独特的结构,是人类与其他动物之间最大的神经系统差异,更是我们作为智能生命体自我意识载体的生物学根基。几周前, 哈佛医学院与宾夕法尼亚大学的合作团队在期刊内恰,啊不,《自然》上发表论文我们利用空间转录组技术直接分析人脑样本绘制出迄今为止最大规模的人脑皮层发育图谱,以前所未有的精度揭示了大脑皮层在发育过程中如何实现层级结构与区域分化的过程这期视频将由论文的第一作者和共通讯作者为大家讲解。



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空间转录组学揭示人类大脑皮层层次与区域的特异化
Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area specification

https://www.nature.com/articles/s41586-025-09010-1

Xuyu Qian, Kyle Coleman, Shunzhou Jiang, Andrea J. Kriz, Jack H. Marciano, Chunyu Luo, Chunhui Cai, Monica Devi Manam, Emre Caglayan, Abbe Lai, David Exposito-Alonso, Aoi Otani, Urmi Ghosh, Diane D. Shao, Rebecca E. Andersen, Jennifer E. Neil, Robert Johnson, Alexandra LeFevre, Jonathan L. Hecht, Nicola Micali, Nenad Sestan, Pasko Rakic, Michael B. Miller, Liang Sun, …Christopher A. Walsh

人类大脑皮层由六个层次和数十个在分子与结构上各具特色的区域构成。尽管单细胞转录组学推动了对皮层发育的分子解析,细胞解离过程中丢失空间背景仍留下重要空白。本研究结合多重误差稳健荧光原位杂交(MERFISH)及深度学习核分割技术,在单细胞空间分辨率下系统描绘了人胎脑皮层的分子、细胞及细胞构筑学发育图谱。该图谱涵盖七个发育阶段、八个皮层区域,总计超过一千八百万个单细胞。

我们发现:在传统细胞构筑学层可见前约三个月,六层结构便已通过兴奋性神经元亚型的层状分布而提前建立。中期妊娠期呈现两种皮层区域特化模式:(1)大多数区域沿前-后轴呈连续渐变;(2)初级(V1)与次级(V2)视觉皮层之间则出现离散、突变式边界,最早可追溯至妊娠第20周。V1–V2 神经元亚型的截然二元分布挑战了“中期妊娠皮层区域化仅是梯度过渡”的传统观点。进一步将单核 RNA 测序与 MERFISH 融合分析揭示,V1 特异性第 4 层神经元早期即上调了突触发生相关基因。

综上,空间关系在决定皮层层次与区域的分子特征中起关键作用。本研究确立了空间分辨单细胞分析范式,为构建人脑发育的综合图谱奠定了基础。

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大脑皮层是人脑中最关键、最独特的结构,是人类与其他动物之间最大的神经系统差异,更是我们作为智能生命体自我意识载体的生物学根基。几周前, 哈佛医学院与宾夕法尼亚大学的合作团队在期刊内恰,啊不,《自然》上发表论文我们利用空间转录组技术直接分析人脑样本绘制出迄今为止最大规模的人脑皮层发育图谱,以前所未有的精度揭示了大脑皮层在发育过程中如何实现层级结构与区域分化的过程这期视频将由论文的第一作者和共通讯作者为大家讲解。

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