PDB تحلیل و بررسی پایگاه داده.pdf
1.4 MB
⚡️پایگاهی از ساختارهای سهبعدی بیومولکولها⚡️
🧬 پایگاه «PDB» یک منبع دادهی علمی، جامع و رایگان در حوزهی بیوانفورماتیک ساختاری و زیستشناسی مولکولی است که برای ثبت، سازماندهی و بهاشتراکگذاری ساختارهای سهبعدی پروتئینها، اسیدهای نوکلئیک، کمپلکسها و سایر بیومولکولها ایجاد شدهاست.
📌این پایگاه با ادغام دادههای «X-ray» ،«Cryo-EM» و نتایج تکنیکهای «crystallography» و «NMR spectroscopy»، مرجع اصلی پژوهشگران علومزیستی است.
🔷 قابلیتهای PDB:
1⃣ جستوجوی پیشرفته براساس نام پروتئین، شناسهی «PDB ID»، اُرگانیسم یا مسیر زیستی.
2⃣ مشاهده و دانلود مدلهای سهبعدی جهت تحلیل و شبیهسازی مولکولی.
3⃣ ارائهی anotations دقیق در مورد ساختار، عملکرد و تعاملات.
❓تابهحال از PDB برای شبیهسازی مولکولی، طراحی دارو یا مدلسازی داکینگ استفاده کردهاید؟ تجربهتون رو برای ما بنویسید.
✍🏻 زینب کارگر
🔗 لینک پایگاه:
https://www.rcsb.org
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
🧬 پایگاه «PDB» یک منبع دادهی علمی، جامع و رایگان در حوزهی بیوانفورماتیک ساختاری و زیستشناسی مولکولی است که برای ثبت، سازماندهی و بهاشتراکگذاری ساختارهای سهبعدی پروتئینها، اسیدهای نوکلئیک، کمپلکسها و سایر بیومولکولها ایجاد شدهاست.
📌این پایگاه با ادغام دادههای «X-ray» ،«Cryo-EM» و نتایج تکنیکهای «crystallography» و «NMR spectroscopy»، مرجع اصلی پژوهشگران علومزیستی است.
🔷 قابلیتهای PDB:
1⃣ جستوجوی پیشرفته براساس نام پروتئین، شناسهی «PDB ID»، اُرگانیسم یا مسیر زیستی.
2⃣ مشاهده و دانلود مدلهای سهبعدی جهت تحلیل و شبیهسازی مولکولی.
3⃣ ارائهی anotations دقیق در مورد ساختار، عملکرد و تعاملات.
❓تابهحال از PDB برای شبیهسازی مولکولی، طراحی دارو یا مدلسازی داکینگ استفاده کردهاید؟ تجربهتون رو برای ما بنویسید.
✍🏻 زینب کارگر
🔗 لینک پایگاه:
https://www.rcsb.org
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
🔥13❤7👍1
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
✨ اُمیکس: مسیر نوین پیشگیری و درمان فردمحور
🦠 بدن ما میزبان تریلیونها میکروب است؛ باکتریها، ویروسها و قارچهایی که وزنشان به ۳ تا ۵ کیلوگرم میرسد و بخش جداییناپذیر از حیات ما هستند.
🧬 میکروبیوم روده غذای ما را هضم میکند، ویتامینهای ضروری میسازد و حتی بر متابولیسم و رفتار اثر میگذارد. تغییر در این اجتماع میکروبی با دیابت، چاقی، بیماریهای التهابی روده و حتی افسردگی و اوتیسم ارتباط دارد.
🚀 پژوهشها نشان میدهد میکروبیوم میتواند مسیرهایی غیرمنتظره مانند حملات قلبی را هم تحتتأثیر قرار دهد. در مأموریتهای فضایی چندساله نیز شناخت و کنترل میکروبیوم برای حفظ سلامت فضانوردان حیاتی خواهد بود.
📽 در این ویدیو با نقش شگفتانگیز میکروبیوم در پزشکی فردمحور و آیندهی سلامت آشنا شوید
🧩 ادامه دارد...
🔗 source
💿 همراه با زیرنویس تهیهشده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران و آکادمی اخترزیستشناسی ایران
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
✦ آکادمی اخترزیستشناسی ایران ✦
🦠 بدن ما میزبان تریلیونها میکروب است؛ باکتریها، ویروسها و قارچهایی که وزنشان به ۳ تا ۵ کیلوگرم میرسد و بخش جداییناپذیر از حیات ما هستند.
🧬 میکروبیوم روده غذای ما را هضم میکند، ویتامینهای ضروری میسازد و حتی بر متابولیسم و رفتار اثر میگذارد. تغییر در این اجتماع میکروبی با دیابت، چاقی، بیماریهای التهابی روده و حتی افسردگی و اوتیسم ارتباط دارد.
🚀 پژوهشها نشان میدهد میکروبیوم میتواند مسیرهایی غیرمنتظره مانند حملات قلبی را هم تحتتأثیر قرار دهد. در مأموریتهای فضایی چندساله نیز شناخت و کنترل میکروبیوم برای حفظ سلامت فضانوردان حیاتی خواهد بود.
📽 در این ویدیو با نقش شگفتانگیز میکروبیوم در پزشکی فردمحور و آیندهی سلامت آشنا شوید
🧩 ادامه دارد...
🔗 source
💿 همراه با زیرنویس تهیهشده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران و آکادمی اخترزیستشناسی ایران
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
✦ آکادمی اخترزیستشناسی ایران ✦
🔥11❤6👏1
🧠 رازهای تازه از پیری مغز
👨🦳 با افزایش سن، مغز دستخوش تغییرات عمیق ژنتیکی و مولکولی میشود؛ تغییراتی که میتوانند تواناییهای شناختی، حافظه و یادگیری را تحت تأثیر قرار دهند.
📚 یک مطالعه با استفاده از فناوریهای تکسلولی پیشرفته، این تغییرات را از دوران نوزادی تا صدسالگی بررسی کرده است. نتایج نشان میدهد که ژنهای ضروری برای عملکرد سلولی بهتدریج کاهش مییابند و در مقابل، جهشهای سوماتیک در نورونها به شکلی چشمگیر افزایش پیدا میکنند.
📊 این یافتهها تصویری دقیق از تغییرات مغز در طول عمر ارائه میدهد و گامی مهم در درک بهتر پیری و بیماریهای مرتبط با آن به شمار میرود.
✍🏻 سیدامیرطاها علیپور
🔎 حسن اقبال جهرمی
🖌ویراستار:مریم حکمتی
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
👨🦳 با افزایش سن، مغز دستخوش تغییرات عمیق ژنتیکی و مولکولی میشود؛ تغییراتی که میتوانند تواناییهای شناختی، حافظه و یادگیری را تحت تأثیر قرار دهند.
📚 یک مطالعه با استفاده از فناوریهای تکسلولی پیشرفته، این تغییرات را از دوران نوزادی تا صدسالگی بررسی کرده است. نتایج نشان میدهد که ژنهای ضروری برای عملکرد سلولی بهتدریج کاهش مییابند و در مقابل، جهشهای سوماتیک در نورونها به شکلی چشمگیر افزایش پیدا میکنند.
📊 این یافتهها تصویری دقیق از تغییرات مغز در طول عمر ارائه میدهد و گامی مهم در درک بهتر پیری و بیماریهای مرتبط با آن به شمار میرود.
✍🏻 سیدامیرطاها علیپور
🔎 حسن اقبال جهرمی
🖌ویراستار:مریم حکمتی
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
👍13❤1👌1
فرهیخته گرامی،
آزمون پایانی دورهی جامع بیوانفورماتیک امروز رأس ساعت ٩ صبح آغاز میشود.
جزئیات آزمون:
📝 تعداد سوالات: ١٩٠ سوال
⏰ زمان شروع: ٩:٠٠ صبح
⏳ زمان پایان: ١٠:۴۵ صبح
✅ آزمون نمره منفی ندارد
⏱️ شما فقط بین ساعت ٩:٠٠ تا ٩:٢٠ صبح فرصت ورود به آزمون را دارید.
اگر در این بازه وارد شوید، زمان کامل آزمون برای شما لحاظ خواهد شد.
❗پس از ساعت ٩:٢٠ امکان ورود به آزمون وجود ندارد.
‼️با توجه به تعداد بالای شرکتکنندگان، پیشنهاد میشود از ورود دقیقاً در ساعت ٩ خودداری کرده و ترجیحاً ۲ دقیقه پیش از آغاز آزمون یا چند دقیقه پس از آن وارد سامانه شوید تا از بروز اختلال جلوگیری شود.
🔴توجه داشته باشید که تنها یکبار امکان شرکت در آزمون وجود دارد.
نحوه شرکت در آزمون:
لینک زیر را در کروم past کنید.
https://app.epoll.ir/71412925
در قسمت رمز عبور، شماره همراهی که به عنوان نام کاربری شما در سایت اتحاد زیستشناسان است را وارد نمایید.
و در قسمت نام کاربری شماره همراه+ bio@ را وارد نمایید.
⁉️ مثال:
شماره همراهی که در سامانه اتحاد پنل ساختم:
09337225632
بنابراین نام کاربری برای آزمون
09337225632@bio
و رمز عبور برای آزمون
09337225632
🔴مهم:
وارد کردن شماره به فارسی یا انگلیسی تفاوتی ندارد.
نکات مهم:
🔴در طول آزمون:
به هیچ وجه از صفحه خارج نشوید.
فقط با یک دستگاه و از طریق اینترنت پرسرعت وارد شوید.
⚠️ در صورت رفرش یا خروج از صفحه، پاسخها ذخیره نمیشوند و مسئولیت آن بر عهده داوطلب است.
⚠️ در صورت بروز هرگونه مشکل، لطفاً به آیدی زیر در تلگرام پیام دهید.
@biocan_supportt
آزمون پایانی دورهی جامع بیوانفورماتیک امروز رأس ساعت ٩ صبح آغاز میشود.
جزئیات آزمون:
📝 تعداد سوالات: ١٩٠ سوال
⏰ زمان شروع: ٩:٠٠ صبح
⏳ زمان پایان: ١٠:۴۵ صبح
✅ آزمون نمره منفی ندارد
⏱️ شما فقط بین ساعت ٩:٠٠ تا ٩:٢٠ صبح فرصت ورود به آزمون را دارید.
اگر در این بازه وارد شوید، زمان کامل آزمون برای شما لحاظ خواهد شد.
❗پس از ساعت ٩:٢٠ امکان ورود به آزمون وجود ندارد.
‼️با توجه به تعداد بالای شرکتکنندگان، پیشنهاد میشود از ورود دقیقاً در ساعت ٩ خودداری کرده و ترجیحاً ۲ دقیقه پیش از آغاز آزمون یا چند دقیقه پس از آن وارد سامانه شوید تا از بروز اختلال جلوگیری شود.
🔴توجه داشته باشید که تنها یکبار امکان شرکت در آزمون وجود دارد.
نحوه شرکت در آزمون:
لینک زیر را در کروم past کنید.
https://app.epoll.ir/71412925
در قسمت رمز عبور، شماره همراهی که به عنوان نام کاربری شما در سایت اتحاد زیستشناسان است را وارد نمایید.
و در قسمت نام کاربری شماره همراه+ bio@ را وارد نمایید.
⁉️ مثال:
شماره همراهی که در سامانه اتحاد پنل ساختم:
09337225632
بنابراین نام کاربری برای آزمون
09337225632@bio
و رمز عبور برای آزمون
09337225632
🔴مهم:
وارد کردن شماره به فارسی یا انگلیسی تفاوتی ندارد.
نکات مهم:
🔴در طول آزمون:
به هیچ وجه از صفحه خارج نشوید.
فقط با یک دستگاه و از طریق اینترنت پرسرعت وارد شوید.
⚠️ در صورت رفرش یا خروج از صفحه، پاسخها ذخیره نمیشوند و مسئولیت آن بر عهده داوطلب است.
⚠️ در صورت بروز هرگونه مشکل، لطفاً به آیدی زیر در تلگرام پیام دهید.
@biocan_supportt
ePoll
سامانه جامع جمعآوری اطلاعات، نظرسنجی و تحلیل داده ePoll
ePoll سامانه تحت وب جهت طراحی، جمعآوری و تحلیل پرسشنامهها و فرم ها به صورت آنلاین و آفلاین برای کاربردهای بازاریابی، تحقیقات بازار، نظرسنجی و ارزیابی است
❤8👍1
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
من و نتایج توالی یابی DNA، وقتی اولای نتایج رومیبینم: 👩🔬😎
من وقتی به آخراش میرسم: 😵💫🤯
#bioinformatic_meme
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
من وقتی به آخراش میرسم: 😵💫🤯
#bioinformatic_meme
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
😁15🤩3👍2🤯1
The Genomics of Us
آکادمی بیوانفورماتیک ایران
ژنوم، داستان مشترک ما🧬
تا حالا فکر کردی که چه چیزی ما رو «ما» میکنه؟ 🤔
از رنگ چشم و قد گرفته تا استعدادها، بیماریها و حتی واکنش به داروها… همه و همه توی ژنوم ما نوشته شدن.
🔬 توی این اپیزود جدید پادکست آکادمی بیوانفورماتیک ایران، میریم سراغ ژنوم انسان و اینکه چطور خوندن و درک کردنش میتونه آیندهی پزشکی و سلامت رو متحول کنه.
از پزشکی شخصی گرفته تا کشف رازهای وراثت، «ژنوم» کلید اصلیه.
🎧 با ما همراه باش تا پرده از رمزهای پنهان ژنوم برداریم.
👥 تیم تولید این قسمت:
• روایت: پریسا عیسوند
• متن: آیداسادات موسوی
• تدوین: حمیدرضا شیرمحمدی
📩 تو هم میتونی برداشتت از اپیزود رو با ما به اشتراک بذاری؛ ما منتظریم!
📡 آکادمی بیوانفورماتیک ایران
@ir_bioinf_group
تا حالا فکر کردی که چه چیزی ما رو «ما» میکنه؟ 🤔
از رنگ چشم و قد گرفته تا استعدادها، بیماریها و حتی واکنش به داروها… همه و همه توی ژنوم ما نوشته شدن.
🔬 توی این اپیزود جدید پادکست آکادمی بیوانفورماتیک ایران، میریم سراغ ژنوم انسان و اینکه چطور خوندن و درک کردنش میتونه آیندهی پزشکی و سلامت رو متحول کنه.
از پزشکی شخصی گرفته تا کشف رازهای وراثت، «ژنوم» کلید اصلیه.
🎧 با ما همراه باش تا پرده از رمزهای پنهان ژنوم برداریم.
👥 تیم تولید این قسمت:
• روایت: پریسا عیسوند
• متن: آیداسادات موسوی
• تدوین: حمیدرضا شیرمحمدی
📩 تو هم میتونی برداشتت از اپیزود رو با ما به اشتراک بذاری؛ ما منتظریم!
📡 آکادمی بیوانفورماتیک ایران
@ir_bioinf_group
👏15❤3👍1🔥1🤯1
Bioinformatics_Talking_to_NCBI_with_R_and_PYTHON.zip
62.8 KB
🔶 این نوتبوک شامل مثالهایی از کار با پایگاه دادههای NCBI با استفاده از هر دو زبان Python و R است.
📌 محتوا:
1⃣ آموزش نصب کتابخانههای مورد نیاز (BioPython ،rentrez ،rpy2).
2⃣ نمایش نحوهی جستوجو و دریافت اطلاعات از پایگاههای داده NCBI (مانند PubMed و Nucleotide).
3⃣ مقایسه کدهای معادل در Python و R برای هر عملیات.
4⃣ استفاده از سلولهای کد و مارکداون برای توضیح و نمایش نتایج.
📍 طرز استفاده:
1⃣ ابتدا سلول نصب کتابخانهها را اجرا کنید تا پکیجهای مورد نیاز نصب شوند.
2⃣ برای اجرای کدهای R، مطمئن شوید افزونه rpy2 در Jupyter فعال است.
3⃣ هر بخش با عنوان رنگی Python (زرد/آبی) یا R (آبی) مشخص شدهاست.
4⃣ سلولهای کد را بهترتیب اجرا کنید تا نتایج را مشاهده نمایید.
⭕️ در صورت بروز خطا در نصب یا اجرا، مطمئن شوید که اینترنت فعال است و نسخههای پایتون و R بهدرستی نصب شدهاند.
🔅 موفق باشید!
✍🏻 میلاد هاشمی
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
📌 محتوا:
1⃣ آموزش نصب کتابخانههای مورد نیاز (BioPython ،rentrez ،rpy2).
2⃣ نمایش نحوهی جستوجو و دریافت اطلاعات از پایگاههای داده NCBI (مانند PubMed و Nucleotide).
3⃣ مقایسه کدهای معادل در Python و R برای هر عملیات.
4⃣ استفاده از سلولهای کد و مارکداون برای توضیح و نمایش نتایج.
📍 طرز استفاده:
1⃣ ابتدا سلول نصب کتابخانهها را اجرا کنید تا پکیجهای مورد نیاز نصب شوند.
2⃣ برای اجرای کدهای R، مطمئن شوید افزونه rpy2 در Jupyter فعال است.
3⃣ هر بخش با عنوان رنگی Python (زرد/آبی) یا R (آبی) مشخص شدهاست.
4⃣ سلولهای کد را بهترتیب اجرا کنید تا نتایج را مشاهده نمایید.
⭕️ در صورت بروز خطا در نصب یا اجرا، مطمئن شوید که اینترنت فعال است و نسخههای پایتون و R بهدرستی نصب شدهاند.
🔅 موفق باشید!
✍🏻 میلاد هاشمی
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
❤17🔥7🙏3👏2
🌱 هر ایدهای که در دنیای زیستی متولد میشه،
میتونه مسیر درمان و سلامت رو تغییر بده،
اما تنها وقتی به واقعیت میرسه که با تخصص، سرمایه و فناوری همراه بشه.
✨ بایوتلنت یعنی همون اکوسیستمی که این اتصال رو ایجاد میکنه:
جایی که ذهنهای خلاق و متخصصان با هم کار میکنن
و نوآوریهای واقعی شکل میگیرن.
🚀 اگر دنبال جایی هستی که با این مسیر آشنا بشی بایوتلنت همونجاست.
لینک ثبتنام:
https://biologyevents.ir/Symposium/753
#بایو_تلنت #اتحاد_زیستشناسان_ایران #صنعت #
میتونه مسیر درمان و سلامت رو تغییر بده،
اما تنها وقتی به واقعیت میرسه که با تخصص، سرمایه و فناوری همراه بشه.
✨ بایوتلنت یعنی همون اکوسیستمی که این اتصال رو ایجاد میکنه:
جایی که ذهنهای خلاق و متخصصان با هم کار میکنن
و نوآوریهای واقعی شکل میگیرن.
🚀 اگر دنبال جایی هستی که با این مسیر آشنا بشی بایوتلنت همونجاست.
لینک ثبتنام:
https://biologyevents.ir/Symposium/753
#بایو_تلنت #اتحاد_زیستشناسان_ایران #صنعت #
🔥9👏4👌3
🧬 تحولی نو در مهندسی پروتئین
🧑🏻🔬 پژوهشگران با استفاده از مدلهای زبان بیوفیزیکی موفق شدهاند پروتئینهای تازه و کارآمدی طراحی کنند؛ دستاوردی که میتواند مسیر داروسازی و درمانهای پزشکی را متحول کند.
📜 این تحقیق، به رهبری سم گلمان و همکارانش، مدلی به نام METL (مدل انتقال یادگیری اثر جهش) را معرفی کرده است. این مدل با ترکیب یادگیری ماشین و شبیهسازیهای بیوفیزیکی، از دادههای تکاملی و مولکولی برای پیشبینی ویژگیهای پروتئینها بهره میبرد.
✅ از آنجا که پروتئینها نقشی کلیدی در فرآیندهای زیستی دارند، این فناوری امکان طراحی پروتئینهای سفارشی با ویژگیهای خاص را فراهم میکند. نتیجه چنین رویکردی میتواند به تولید داروهای نوین، درمان بیماریها و حتی نوآوری در صنایع غذایی منجر شود.
✍🏻 سیدامیرطاها علیپور
🔎حسن اقبال جهرمی
🖌ویراستار:مریم حکمتی
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
🧑🏻🔬 پژوهشگران با استفاده از مدلهای زبان بیوفیزیکی موفق شدهاند پروتئینهای تازه و کارآمدی طراحی کنند؛ دستاوردی که میتواند مسیر داروسازی و درمانهای پزشکی را متحول کند.
📜 این تحقیق، به رهبری سم گلمان و همکارانش، مدلی به نام METL (مدل انتقال یادگیری اثر جهش) را معرفی کرده است. این مدل با ترکیب یادگیری ماشین و شبیهسازیهای بیوفیزیکی، از دادههای تکاملی و مولکولی برای پیشبینی ویژگیهای پروتئینها بهره میبرد.
✅ از آنجا که پروتئینها نقشی کلیدی در فرآیندهای زیستی دارند، این فناوری امکان طراحی پروتئینهای سفارشی با ویژگیهای خاص را فراهم میکند. نتیجه چنین رویکردی میتواند به تولید داروهای نوین، درمان بیماریها و حتی نوآوری در صنایع غذایی منجر شود.
✍🏻 سیدامیرطاها علیپور
🔎حسن اقبال جهرمی
🖌ویراستار:مریم حکمتی
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
🔥12❤4👌1💯1
اسامی_نفرات_برتر_دوره_جامع_بیوانفورماتیک.pdf
151.9 KB
🏆 تبریک به نفرات برتر آزمون دورهی جامع بیوانفورماتیک
و با آرزوی موفقیت برای همگی شرکتکنندگان دوره 🌱
نکته اول:
فارغ از نتیجه آزمون همه میتوانند در کارآموزی دوره با هزینه شرکت کنند.
نکته دوم:
فارغ از نتیجه آزمون، همه می توانند در دوره دوم بیوانفورماتیک ثبت نام کنند.
نکته سوم:
آزمون مجدد دوره در تاریخ 18 مهرماه برگزار خواهد شد.
این آزمون صرفاً با هدف دریافت گواهی قبولی برگزار میگردد.
❗️ افرادی که نام آنها در فایل درج شده است، لطفا به آیدی @mn_egintb80 برای عضویت در گروه کاراموزی پیام بدهند.
و با آرزوی موفقیت برای همگی شرکتکنندگان دوره 🌱
نکته اول:
فارغ از نتیجه آزمون همه میتوانند در کارآموزی دوره با هزینه شرکت کنند.
نکته دوم:
فارغ از نتیجه آزمون، همه می توانند در دوره دوم بیوانفورماتیک ثبت نام کنند.
نکته سوم:
آزمون مجدد دوره در تاریخ 18 مهرماه برگزار خواهد شد.
این آزمون صرفاً با هدف دریافت گواهی قبولی برگزار میگردد.
❗️ افرادی که نام آنها در فایل درج شده است، لطفا به آیدی @mn_egintb80 برای عضویت در گروه کاراموزی پیام بدهند.
❤🔥22👏2
💾پایان هارددیسکها در آینده با ذخیرهسازی داده در DNA
📈 با افزایش انفجاری حجم دادهها در جهان، فناوریهای سنتی ذخیرهسازی به زودی به حد نهایی خود خواهند رسید. پروژه BIOSYNTH، با همکاری سه موسسه فرانهوفر، راهحلی نوین و پیشگامانه ارائه میدهد: ذخیرهسازی دادهها روی DNA مصنوعی.
🧬 مولکول DNA به عنوان یک مولکول طبیعی، توانایی ذخیره حجم عظیمی از اطلاعات در فضای بسیار کوچک و برای مدتزمان طولانی را دارد. در این فناوری، دادههای دیجیتال (صفر و یک) به توالیهای مصنوعی از نوکلئوبازها (A, C, G, T) ترجمه و سپس روی تراشههای میکرو سنتز میشوند.
💻 پلتفرم میکروتراشه توسعهیافته در این پروژه، با استفاده از هزاران سلول واکنش کوچک، المنتهای گرمایشی، دیودهای نوری (OLED) و حسگرها، امکان سنتز کارآمد و پایش لحظهای فرآیند را فراهم میکند. این سیستم نه تنها راه را برای آرشیو طولانیمدت دادهها هموار میکند، بلکه در آیندهای نزدیک در حوزههای پزشکی شخصی ، زیستشناسی و غربالگری مواد آلاینده نیز کاربرد خواهد داشت.
✍🏻سهیلا سلحشورفرد
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
📈 با افزایش انفجاری حجم دادهها در جهان، فناوریهای سنتی ذخیرهسازی به زودی به حد نهایی خود خواهند رسید. پروژه BIOSYNTH، با همکاری سه موسسه فرانهوفر، راهحلی نوین و پیشگامانه ارائه میدهد: ذخیرهسازی دادهها روی DNA مصنوعی.
🧬 مولکول DNA به عنوان یک مولکول طبیعی، توانایی ذخیره حجم عظیمی از اطلاعات در فضای بسیار کوچک و برای مدتزمان طولانی را دارد. در این فناوری، دادههای دیجیتال (صفر و یک) به توالیهای مصنوعی از نوکلئوبازها (A, C, G, T) ترجمه و سپس روی تراشههای میکرو سنتز میشوند.
💻 پلتفرم میکروتراشه توسعهیافته در این پروژه، با استفاده از هزاران سلول واکنش کوچک، المنتهای گرمایشی، دیودهای نوری (OLED) و حسگرها، امکان سنتز کارآمد و پایش لحظهای فرآیند را فراهم میکند. این سیستم نه تنها راه را برای آرشیو طولانیمدت دادهها هموار میکند، بلکه در آیندهای نزدیک در حوزههای پزشکی شخصی ، زیستشناسی و غربالگری مواد آلاینده نیز کاربرد خواهد داشت.
✍🏻سهیلا سلحشورفرد
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
❤7💯3🔥2👌2🆒2👏1👨💻1
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
🧬 کشف ژنومها با CGView: نقشهبرداری بصری ژنومها
🦠 تصور کنید بتوانید ژنوم یک میکروب را در قالب یک نقشه دایرهای دقیق و زیبا ببینید! با CGView میتوانید تمام ویژگیهای ژنومی از جمله CDS، rRNA، tRNA، المانهای متحرک و نواحی تکراری را به صورت کاملاً تصویری تحلیل کنید.
🎨 این ابزار به شما این امکان را میدهد که رنگها، برچسبها و فونتها را شخصیسازی کنید، مسیرهای forward و reverse را بررسی کنید و شاخصهایی مثل GC content و GC skew را اضافه کنید. خروجی با کیفیت بالا (PNG, JPG, SVG) قابل ذخیره است تا بتوانید آن را در تحقیقات یا ارائهها استفاده کنید.
🔗 Source
💿 همراه با زیرنویس تهیهشده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
🦠 تصور کنید بتوانید ژنوم یک میکروب را در قالب یک نقشه دایرهای دقیق و زیبا ببینید! با CGView میتوانید تمام ویژگیهای ژنومی از جمله CDS، rRNA، tRNA، المانهای متحرک و نواحی تکراری را به صورت کاملاً تصویری تحلیل کنید.
🎨 این ابزار به شما این امکان را میدهد که رنگها، برچسبها و فونتها را شخصیسازی کنید، مسیرهای forward و reverse را بررسی کنید و شاخصهایی مثل GC content و GC skew را اضافه کنید. خروجی با کیفیت بالا (PNG, JPG, SVG) قابل ذخیره است تا بتوانید آن را در تحقیقات یا ارائهها استفاده کنید.
🔗 Source
💿 همراه با زیرنویس تهیهشده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
🔥7❤4🤩4👏2👌2
بسته_ICGE_برای_تحلیل_خوشه_بندی_بیان_ژن_در_R.pdf
1.2 MB
⚡️تحلیل هوشمند خوشهبندی بیانژن⚡️
🧬 بستهی «ICGE» یک ابزار قدرتمند و رایگان در محیط «R» برای شناسایی و ارزیابی ساختارهای خوشهای دادههای بیانژن است. این بسته به پژوهشگران ژنومیکس و ترنسکریپتومیکس کمک میکند تا الگوهای پنهان در دادههای پیچیدهی «omics» را کشف کنند.
📌بستهی «ICGE» با ترکیب الگوریتمهای خوشهبندی پیشرفته، روشهای آماری دقیق و معیارهای ارزیابی، ابزاری جامع برای تحلیل دادههای میکرواری و «RNA-seq» فراهم میسازد.
🔷 قابلیتهای ICGE:
1⃣ انتخاب و اجرای روشهای متنوع خوشهبندی (hierarchical ،k-means و SOM و...).
2⃣ ارزیابی کیفیت خوشهها با معیارهایی مانند «Silhouette» ،«Dunn» و «Calinski-Harabasz».
3⃣ شناسایی خوشههای پایدار با دادههای بیولوژیکی واقعی و شبیهسازیشده.
❓دیگر چه ابزارهایی مانند ICGE در محیط R را میشناسید که برای پژوهش در حوزهی omics کاربردی هستند؟ توی کامنتها برامون بنویسید.
✍🏻 پگاه اسدی
🔗 لینک مستندات و نصب:
https://cran.r-project.org/package=ICGE
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
🧬 بستهی «ICGE» یک ابزار قدرتمند و رایگان در محیط «R» برای شناسایی و ارزیابی ساختارهای خوشهای دادههای بیانژن است. این بسته به پژوهشگران ژنومیکس و ترنسکریپتومیکس کمک میکند تا الگوهای پنهان در دادههای پیچیدهی «omics» را کشف کنند.
📌بستهی «ICGE» با ترکیب الگوریتمهای خوشهبندی پیشرفته، روشهای آماری دقیق و معیارهای ارزیابی، ابزاری جامع برای تحلیل دادههای میکرواری و «RNA-seq» فراهم میسازد.
🔷 قابلیتهای ICGE:
1⃣ انتخاب و اجرای روشهای متنوع خوشهبندی (hierarchical ،k-means و SOM و...).
2⃣ ارزیابی کیفیت خوشهها با معیارهایی مانند «Silhouette» ،«Dunn» و «Calinski-Harabasz».
3⃣ شناسایی خوشههای پایدار با دادههای بیولوژیکی واقعی و شبیهسازیشده.
❓دیگر چه ابزارهایی مانند ICGE در محیط R را میشناسید که برای پژوهش در حوزهی omics کاربردی هستند؟ توی کامنتها برامون بنویسید.
✍🏻 پگاه اسدی
🔗 لینک مستندات و نصب:
https://cran.r-project.org/package=ICGE
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
❤6⚡4👏3👌3🔥2🤩2🙏1
✈️ کمکخلبان هوشمند برای تحقیقات اُمیکس
💻 یک سیستم بیوانفورماتیک با هوش دادهای بالا، پژوهشگران را قادر میسازد دادههای عظیم ژنومی، پروتئومی و ترنسکریپتومی را با سرعت و دقت بیشتری تحلیل کرده و به بینشهای علمی عمیقتری دست یابند.
📊 این پلتفرم مانند یک «کمکخلبان دیجیتال» عمل میکند؛ مسیر تحلیل دادههای اُمیکس را سادهتر و کارآمدتر میسازد، الگوهای پنهان را آشکار میکند و در نتیجه زمان و تلاش پژوهشگران را کاهش میدهد.
🔬 به کمک این فناوری، انجام تحلیلهای پیچیده در مقیاس بزرگ سریعتر امکانپذیر است و محققان میتوانند تصمیمات علمی مؤثرتری برای پزشکی شخصیسازیشده و کشف دارو اتخاذ کنند؛ قابلیتی که با مدیریت حجم عظیم دادهها و استخراج بینشهای کاربردی، این سیستم را به ابزاری ارزشمند در تحقیقات اُمیکس تبدیل کرده است.
✍🏻 زینب کارگر
🔍 آیناز نصیری
🖌ویراستار:مریم حکمتی
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
💻 یک سیستم بیوانفورماتیک با هوش دادهای بالا، پژوهشگران را قادر میسازد دادههای عظیم ژنومی، پروتئومی و ترنسکریپتومی را با سرعت و دقت بیشتری تحلیل کرده و به بینشهای علمی عمیقتری دست یابند.
📊 این پلتفرم مانند یک «کمکخلبان دیجیتال» عمل میکند؛ مسیر تحلیل دادههای اُمیکس را سادهتر و کارآمدتر میسازد، الگوهای پنهان را آشکار میکند و در نتیجه زمان و تلاش پژوهشگران را کاهش میدهد.
🔬 به کمک این فناوری، انجام تحلیلهای پیچیده در مقیاس بزرگ سریعتر امکانپذیر است و محققان میتوانند تصمیمات علمی مؤثرتری برای پزشکی شخصیسازیشده و کشف دارو اتخاذ کنند؛ قابلیتی که با مدیریت حجم عظیم دادهها و استخراج بینشهای کاربردی، این سیستم را به ابزاری ارزشمند در تحقیقات اُمیکس تبدیل کرده است.
✍🏻 زینب کارگر
🔍 آیناز نصیری
🖌ویراستار:مریم حکمتی
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
🔥7🤩3💯3❤2👏2🆒2🤯1
✨ از ایده تا اثر واقعی ✨
اگه دنبال یه تجربه علمی متفاوتی، Cancer BioTalent منتظرته.
جایی که علم از دل ایدهها بیرون میاد و تبدیل میشه به امید، راهحل و ارتباط واقعی.
📍 ۱۰ مهر ۱۴۰۴
📍 سالن ابوریحان، دانشگاه شهید بهشتی
فرقی نمیکنه ایدهت انتخاب شده باشه یا نه اگه کنجکاوی، مشتاقی و دنبال ساختن آیندهای روشنتر هستی، اینجا جای توئه.
بیوانفورماتیک، هوش مصنوعی، تشخیص زودهنگام، روشهای حمایتی و کلی مسیر دیگه منتظرن تا با فکرهای تازهی شما شکل بگیرن.
🧠 فقط یه فکر ساده میتونه شروع یه تغییر بزرگ باشه.
برای ثبتنام کلمه بایوتلنت را در پست زیر کامنت کنید.
#CANCER_BIOTALENT
#بایو_تلنت
#آکادمی_بیوانفورماتیک_ایران
#اکادمی_ژنتیک_ایران
#رویداد_علمی
اگه دنبال یه تجربه علمی متفاوتی، Cancer BioTalent منتظرته.
جایی که علم از دل ایدهها بیرون میاد و تبدیل میشه به امید، راهحل و ارتباط واقعی.
📍 ۱۰ مهر ۱۴۰۴
📍 سالن ابوریحان، دانشگاه شهید بهشتی
فرقی نمیکنه ایدهت انتخاب شده باشه یا نه اگه کنجکاوی، مشتاقی و دنبال ساختن آیندهای روشنتر هستی، اینجا جای توئه.
بیوانفورماتیک، هوش مصنوعی، تشخیص زودهنگام، روشهای حمایتی و کلی مسیر دیگه منتظرن تا با فکرهای تازهی شما شکل بگیرن.
🧠 فقط یه فکر ساده میتونه شروع یه تغییر بزرگ باشه.
برای ثبتنام کلمه بایوتلنت را در پست زیر کامنت کنید.
#CANCER_BIOTALENT
#بایو_تلنت
#آکادمی_بیوانفورماتیک_ایران
#اکادمی_ژنتیک_ایران
#رویداد_علمی
❤5🤩3💯3🔥2👏2⚡1
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
✨ آموزش مرحلهبهمرحله تجسم ژنوم با DNA Plotter
🌟 یکی از چالشهای پژوهشگران ژنومیک، تجسم دادههای ژنومی و تحلیل ویژگیهای ژنها بهصورت تصویری است. نرمافزارهای تخصصی نصب و تنظیمات پیچیدهای دارند، اما DNA Plotter و Artemis راهکاری ساده و کارآمد ارائه میدهند.
🧬 در این آموزش یاد میگیرید چگونه ژنومها را از پایگاه NCBI دریافت کرده، با نرمافزار Artemis باز کنید و نقشههای دایرهای و خطی با امکان تغییر رنگ ترکها، اضافه کردن GC plot و GC skew بسازید.
🚀 همچنین نحوه ذخیره خروجیها در فرمتهای PNG و SVG برای ویرایش حرفهای و ارائه تصاویر استاندارد آموزش داده میشود.
📽 بدون نیاز به دانش پیشرفته برنامهنویسی، تنها با چند کلیک میتوانید ژنومهای باکتریایی و دیگر ژنومها را تجسم کنید.
🔗 Source
💿 همراه با زیرنویس تهیهشده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
🌟 یکی از چالشهای پژوهشگران ژنومیک، تجسم دادههای ژنومی و تحلیل ویژگیهای ژنها بهصورت تصویری است. نرمافزارهای تخصصی نصب و تنظیمات پیچیدهای دارند، اما DNA Plotter و Artemis راهکاری ساده و کارآمد ارائه میدهند.
🧬 در این آموزش یاد میگیرید چگونه ژنومها را از پایگاه NCBI دریافت کرده، با نرمافزار Artemis باز کنید و نقشههای دایرهای و خطی با امکان تغییر رنگ ترکها، اضافه کردن GC plot و GC skew بسازید.
🚀 همچنین نحوه ذخیره خروجیها در فرمتهای PNG و SVG برای ویرایش حرفهای و ارائه تصاویر استاندارد آموزش داده میشود.
📽 بدون نیاز به دانش پیشرفته برنامهنویسی، تنها با چند کلیک میتوانید ژنومهای باکتریایی و دیگر ژنومها را تجسم کنید.
🔗 Source
💿 همراه با زیرنویس تهیهشده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
🔥5❤🔥3👏3🤩3👌2💯2⚡1❤1
🗝کلید درمان سرطان در کشف پپتیدهای ضدتومور
👩🏻🔬 محققان با ترکیب هوش مصنوعی و بیوتکنولوژی، چارچوب جدیدی به نام ACP-EPC را برای شناسایی سریع و دقیق پپتیدهای ضد سرطان توسعه دادهاند.
🪄 مزیت اصلی این روش عبارت استاز:افزایش چشمگیر دقت پیشبینی پپتیدهای موثر، استفاده از ویژگیهای چندگانه مانند ساختار فضایی و خصوصیات فیزیکی وشیمیایی ،ارائه تحلیلی شفاف و قابل تفسیر از ویژگیهای بحرانی
✅ پپتیدها به دلیل سمیت کمتر و هدفمندی بالاتر، جایگزین امیدوارکنندهای برای داروهای شیمیدرمانی سنتی هستند. این فناوری نوین، روند کشف داروهای جدید را سریعتر و مقرونبهصرفه کرده و راه را برای درمانهای شخصیسازیشده سرطان هموار میکند
✍🏻زهرا مهرابی
🔍سهیلا سلحشورفرد
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
👩🏻🔬 محققان با ترکیب هوش مصنوعی و بیوتکنولوژی، چارچوب جدیدی به نام ACP-EPC را برای شناسایی سریع و دقیق پپتیدهای ضد سرطان توسعه دادهاند.
🪄 مزیت اصلی این روش عبارت استاز:افزایش چشمگیر دقت پیشبینی پپتیدهای موثر، استفاده از ویژگیهای چندگانه مانند ساختار فضایی و خصوصیات فیزیکی وشیمیایی ،ارائه تحلیلی شفاف و قابل تفسیر از ویژگیهای بحرانی
✅ پپتیدها به دلیل سمیت کمتر و هدفمندی بالاتر، جایگزین امیدوارکنندهای برای داروهای شیمیدرمانی سنتی هستند. این فناوری نوین، روند کشف داروهای جدید را سریعتر و مقرونبهصرفه کرده و راه را برای درمانهای شخصیسازیشده سرطان هموار میکند
✍🏻زهرا مهرابی
🔍سهیلا سلحشورفرد
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
🔥7❤5👏4🤩3🤯2💯2❤🔥1⚡1🏆1
Forwarded from کانال اتحاد زیستشناسان ایران
🔬بسیاری از فارغالتحصیلان زیستشناسی پس از پایان تحصیل با چالشهای جدی برای پیدا کردن شغل روبهرو میشوند. بیشتر آنها تنها گزینه شغلی را کار در آزمایشگاه میبینند، اما در عمل با محدودیت و درهای بسته مواجه میشوند.
در حالیکه صنعت زیستفناوری و داروسازی یکی از مهمترین حوزههای کاری برای زیستشناسان است. مشکل اصلی، آشنا نبودن با شرکتها و مسیر ورود به این فضاست.
🌐 رویداد بایوتلنت پلی میان دانشگاه و صنعت است. سه شرکت مطرح این حوزه:
1️⃣ فارمد بهین آزما
2️⃣ سیناژن
3️⃣ نانو فناوران دارویی الوند
4⃣ارکید فارمد
5⃣صندوق خطر پذیری نقدینه
6⃣کوبل دارو
💬با غرفههای اختصاصی حضور دارند تا بتوانید مستقیماً با متخصصان آنها گفتوگو کنید، مسیر شغلی خود را مشخص کنید و با فضای واقعی صنعت از نزدیک آشنا شوید.
📌تنها ۷ روز تا شروع رویداد بایوتلنت باقیمانده است.
✨منتظر حضور سبز شما هستیم
🔗 لینک ثبتنام
اینستاگرام | تلگرام | لینکدین | درباره ما
┏━━━━━━
🆔 @UIBiologists🌱💡
┗━━━━━━
در حالیکه صنعت زیستفناوری و داروسازی یکی از مهمترین حوزههای کاری برای زیستشناسان است. مشکل اصلی، آشنا نبودن با شرکتها و مسیر ورود به این فضاست.
🌐 رویداد بایوتلنت پلی میان دانشگاه و صنعت است. سه شرکت مطرح این حوزه:
1️⃣ فارمد بهین آزما
2️⃣ سیناژن
3️⃣ نانو فناوران دارویی الوند
4⃣ارکید فارمد
5⃣صندوق خطر پذیری نقدینه
6⃣کوبل دارو
💬با غرفههای اختصاصی حضور دارند تا بتوانید مستقیماً با متخصصان آنها گفتوگو کنید، مسیر شغلی خود را مشخص کنید و با فضای واقعی صنعت از نزدیک آشنا شوید.
📌تنها ۷ روز تا شروع رویداد بایوتلنت باقیمانده است.
✨منتظر حضور سبز شما هستیم
🔗 لینک ثبتنام
اینستاگرام | تلگرام | لینکدین | درباره ما
┏━━━━━━
🆔 @UIBiologists🌱💡
┗━━━━━━
❤5🤩2👌2❤🔥1🔥1
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
وقتی فکر میکنی باگ بیوانفورماتیکی درعرض ده دقیقه حل شدنیه😎
همچنان بعد ده ساعت🤕...
#bioinformatic_meme
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
همچنان بعد ده ساعت🤕...
#bioinformatic_meme
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
😁16👍4❤2👏2💯1🆒1😎1
🔬نقشهبرداری از تأثیر درمان سرطان بر محیط ایمنی تومور با دیتابیس CTTIME
👩🏻🔬 محققان پایگاه دادهای به نام «CTTIME» ایجاد کردهاند که تأثیر درمانهای مختلف سرطان بر محیط ایمنی تومور را تحلیل میکند. این پایگاه شامل ۵۳۱۱ نمونه بیوپسی قبل و بعد از درمان از ۲۰ نوع سرطان و ۹ روش درمانی است.
📊 نتایج نشان میدهد برخی داروها مانند مهارکننده HER2 (تراستوزوماب) فعالیت سلولهای NK را افزایش میدهند و شیمیدرمانی نیز باعث تقویت نفوذ سلولهای T کشنده میشود.
💉جالبتر اینکه درمانهای هورمونی در مقایسه با سایر روشها، هماهنگی بیشتری در فعالسازی محیط ایمنی تومور نشان داده و ممکن است اثر ایمنیدرمانی را تقویت کنند. این بانک اطلاعاتی به محققان کمک میکند تا ترکیبهای درمانی جدید و مؤثرتری برای مقابله با سرطان طراحی کنند.
✍🏻سهیلا سلحشورفرد
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
👩🏻🔬 محققان پایگاه دادهای به نام «CTTIME» ایجاد کردهاند که تأثیر درمانهای مختلف سرطان بر محیط ایمنی تومور را تحلیل میکند. این پایگاه شامل ۵۳۱۱ نمونه بیوپسی قبل و بعد از درمان از ۲۰ نوع سرطان و ۹ روش درمانی است.
📊 نتایج نشان میدهد برخی داروها مانند مهارکننده HER2 (تراستوزوماب) فعالیت سلولهای NK را افزایش میدهند و شیمیدرمانی نیز باعث تقویت نفوذ سلولهای T کشنده میشود.
💉جالبتر اینکه درمانهای هورمونی در مقایسه با سایر روشها، هماهنگی بیشتری در فعالسازی محیط ایمنی تومور نشان داده و ممکن است اثر ایمنیدرمانی را تقویت کنند. این بانک اطلاعاتی به محققان کمک میکند تا ترکیبهای درمانی جدید و مؤثرتری برای مقابله با سرطان طراحی کنند.
✍🏻سهیلا سلحشورفرد
💡source
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
❤7🤯2❤🔥1👍1🔥1👏1🍓1😎1