💉واکسن سرطان Enteromix بااثربخشی ۱۰۰درصد در کارآزمایی بالینی

🇷🇺روسیه با معرفی واکسن شخصی‌سازی‌شده سرطان Enteromix، جهان را شگفت‌زده کرد! این واکسن مبتنی بر فناوری mRNA، در کارآزمایی بالینی روی ۴۸ داوطلب، اثربخشی و ایمنی ۱۰۰٪ نشان داده و بدون عوارض جانبی جدی بوده‌است.

✅ واکسن Enteromix با آموزش سیستم ایمنی، سلول‌های سرطانی را دقیقاً شناسایی و نابود می‌کند. این واکسن که حاصل همکاری مرکز تحقیقات پزشکی رادیولوژی و مؤسسه انگلهارت روسیه است، از چهار ویروس بی‌ضرر برای حمله به تومور و تقویت ایمنی استفاده می‌کند و در برخی موارد حتی منجر به توقف کامل سرطان شده‌است.

⏳اکنون تنها مرحله باقی‌مانده، دریافت مجوزهای نهایی است و به زودی شاهد عرضه اولین واکسن شخصی‌سازی‌شده mRNA سرطان در جهان خواهیم بود!

✍🏻 سهیلا سلحشورفرد

💡source

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

📣۲۲ روز تا برگزاری رویداد ملی CANCER BIOTALENT...

💉 درمان سرطان کبد با هوش مصنوعی؛ کشف داروهای جدید با رویکردی نوآورانه

👩🏻‍🔬 پژوهشگران با ترکیب فناوری توالی‌یابی RNA تک‌سلولی و هوش مصنوعی، گامی مهم در درمان سرطان کبد برداشته‌اند. این مطالعه که در نشریه معتبر npj Precision Oncology منتشر شده است، به شناسایی ژن‌های کلیدی در پیشرفت بیماری و مقاومت دارویی انجامید و مسیرهای تازه‌ای برای کشف داروهای چندهدف‌دار گشود.

💻 با بهره‌گیری از مدل‌های پیشرفته هوش مصنوعی، محققان توانستند ژن‌های مؤثر در گریز تومور از سیستم ایمنی را شناسایی کرده و داروهای شناخته‌شده‌ای مانند Fluvastatin را برای بازهدف‌گذاری درمانی پیشنهاد دهند. این رویکرد، راه را برای توسعه‌ی درمان‌های دقیق و شخصی‌سازی‌شده در بیماران مبتلا به سرطان کبد هموار می‌کند.

✍🏻 زهرا حنیفه‌زاده
🔍 ریحانه برزوئی
🖌ویراستار:مریم حکمتی

💡source

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

✨ دانلود داده‌های TCGA با Python (قسمت ۱)

🧬 داده‌های سرطان منبع ارزشمندی برای پژوهشگران و دانشمندان ژنومیکس هستند. دسترسی دقیق و منظم به این داده‌ها، نخستین قدم برای تحلیل‌های پیشرفته و مدل‌سازی یادگیری ماشین است و می‌تواند مسیر تحقیقات دقیق پزشکی را هموار کند.

🔬 در این ویدیو، با استفاده از Python و یک اسکریپت ساده، یاد می‌گیریم چگونه داده‌های یسان ژن را از پایگاه TCGA پیدا و دانلود کنیم. ابتدا فایل مورد نظر را شناسایی می‌کنیم، شناسه‌های UIDs را استخراج می‌کنیم و سپس داده‌ها را به‌صورت خودکار آماده‌ی تحلیل می‌نماییم.

🚀 این آموزش مناسب دانشجویان و پژوهشگران است و امکان دسترسی به داده‌های ساختاریافته برای تحلیل ژن‌بیان و یادگیری ماشین را فراهم می‌کند.

🔗 source

💿 همراه با زیرنویس تهیه‌شده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠  @ir_bioinf_group

🧬 زندگی در خط کد و DNA
یه روز عادی از دکترای بیوانفورماتیک:از خطاهای پایتون صبحگاهی تا یافتن یک الگوی کوچک در میان انبوه دادههای ژنومی عصرگاهی! این ولاگ کوتاه رو از دست ندید 😉

#bioinformatic_vlog


📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

🔬رمزگشایی از اسرار متابولیک سرطان در سطح تک‌سلولی

🧑🏻‍🔬 محققان با توسعه روشی پیشرفته به نام «HT SpaceM»، محدودیت‌های موجود در مطالعه متابولیت‌های سلولی را شکسته‌اند. این فناوری با ترکیب میکروسکوپی پیشرفته و طیف‌سنجی جرمی، امکان بررسی همزمان ده‌ها هزار سلول را با دقتی بی‌سابقه فراهم می‌کند.

📚 در این مطالعه، محققان با تحلیل بیش از ۱۴۰٬۰۰۰ سلول از نمونه‌های مختلف از جمله خطوط سلولی سرطانی، موفق به شناسایی ۷۳ متابولیت کوچک با تایید روش‌های استاندارد طلایی شدند. این روش نه تنها بیومارکرهای متابولیک خاص هر نوع سلول را شناسایی کرد، بلکه ناهمگونی عمیق متابولیکی حتی بین سلول‌های تحت یک شرایط یکسان را نیز آشکار ساخت.

💡یکی از یافته‌های کلیدی، مشاهده هماهنگی متابولیک جدید حول محور گلوکز در پاسخ به مهار گلیکولیز بود که درک جدیدی از سازوکارهای تطابق سلول‌های سرطانی ارائه می‌دهد.

✍🏻سهیلا سلحشورفرد
🔍آیناز نصیری

💡source

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

✨ دانلود داده‌های TCGA با Python (قسمت ۲)

🧮 در این ویدیو، با استفاده از یک اسکریپت Python، داده‌های بیان ژن از پایگاه TCGA انتخاب و آماده‌سازی می‌شوند. یاد می‌گیرید چگونه فایل manifest دریافت کنید، UIDs استخراج کنید و فایل‌ها را به‌صورت خودکار دانلود نمایید.

📊 همچنین روش‌های جایگزین مانند استفاده از pandas یا GDC client برای مدیریت و آماده‌سازی داده‌ها برای تحلیل‌های بیان ژن و یادگیری ماشین معرفی شده است.

🚀 این آموزش مناسب افرادی است که می‌خواهند داده‌های سرطان را به‌صورت ساختاریافته و آماده برای تحلیل‌های پیشرفته در اختیار داشته باشند.

🔗 source

💿 همراه با زیرنویس تهیه‌شده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠  @ir_bioinf_group

👩🏻‍💻 برنامه‌نویسی؛ خلق سرزمین‌های جدید در دنیای کد و ماژول

⚡️برنامه‌نویسان معماران دنیای دیجیتال هستند؛ خالقانی که با کد و داده، مسیرهای تازه‌ای در علم و فناوری می‌گشایند. آنان کلید حل پیچیده‌ترین معماها را در انبوه داده‌ها می‌یابند و با ذهن‌های خلاق و تلاش بی‌وقفه، به جهان نظم و معنا می‌بخشند.

✨امروز فرصتی است برای قدردانی از این هنرمندان خاموش که آینده‌ی علم و فناوری را روشن‌تر می‌سازند.

🧑🏻‍💻روز برنامه‌نویس مبارک...!

⚡️و یک خبر ویژه!

🎁 آکادمی بیوانفورماتیک ایران به مناسبت روز برنامه‌نویس یک چالش جذاب همراه با جایزه‌ برگزار کرده‌است.

✍🏻 برای شرکت در این چالش فقط کافیه به ۴ مسئله در حوزه‌ی پایتون پاسخ بدید.

📌 توجه داشته باشید که مهلت ارسال پاسخ‌ها فقط تا ساعت ۱۲ امشب خواهد بود.

📄 برای دریافت لیست مسائل کلمه «چالش» رو به آیدی زیر ارسال کنید.

🔷@ir_bioinformatic_academy_admin🔷

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

✨ توالی‌یابی RNA تک‌سلولی (scRNA-seq)

🔬 در این ویدئو با یکی از پیشرفته‌ترین روش‌های ترنسکریپتومیک آشنا می‌شوید که بیان ژن را در سطح هر سلول به‌طور جداگانه بررسی می‌کند. این فناوری به کمک microfluidics و barcoded beads، ناهمگنی سلولی را آشکار کرده و محدودیت‌های روش‌های bulk RNA-seq را برطرف می‌سازد.

📊 مراحل اصلی شامل آماده‌سازی کتابخانه، کنترل کیفیت و تحلیل داده با الگوریتم‌هایی مانند UMAP است که امکان شناسایی خوشه‌های سلولی و ژن‌های اختصاصی را فراهم می‌کند.

🚀 این روش امروزه در تحقیقات سرطان، نوروساینس و پزشکی دقیق کاربرد گسترده‌ای دارد.
🔗 source

💿 همراه با زیرنویس تهیه‌شده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠  @ir_bioinf_group

📦پکیج هوش مصنوعی Flexynesis برای پیش‌بینی دقیق‌تر سرطان

🧑🏻‍🔬 محققان ابزار جدیدی به نام «Flexynesis» برای یکپارچه‌سازی داده‌های مولتی اومیکس با استفاده از یادگیری عمیق توسعه داده‌اند. این ابزار به‌طور ویژه برای تحقیقات سرطان و پزشکی دقیق طراحی شده و امکان پردازش، انتخاب ویژگی، تنظیم هایپرپارامترها و کشف نشانگرهای زیستی را فراهم می‌کند.

💻 ابزارFlexynesis با پشتیبانی از تحلیل داده‌های حجیم، امکان یکپارچه‌سازی همزمان چندین لایه اومیکسی را فراهم می‌کند. همچنین قابلیت Fine-tuning برای تطبیق با داده‌های جدید و کشف خودکار نشانگرهای دارویی از جمله ویژگی‌های برجسته آن است.

✅ این ابزار به صورت رایگان در پلتفرم‌هایی مانند PyPI، Bioconda و Galaxy در دسترس است و برای استفاده محققان با یا بدون تجربه یادگیری عمیق طراحی شده است. این ابزار گامی مهم به سوی تحلیل یکپارچه و قابل تفسیر داده‌های مولتی‌اومیکس در تحقیقات سرطان است.

✍🏻 سهیلا سلحشورفرد
🔍 ریحانه برزوئی

💡source

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

⚡️کامل‌ترین پایگاه از داده‌های ''miRNA''⚡️

🧬 پایگاه ''miRBase'' یک منبع داده‌ی تخصصی، جامع و رایگان در حوزه‌ی بیوانفورماتیک و ژنومیکس عملکردی است که با هدف ثبت، سازمان‌دهی و دسترسی به توالی‌ها و anotations میکروRNA‌ها از گونه‌های مختلف موجودات ایجاد شده‌است. این پایگاه ''miRNA''های شناخته‌شده را جست‌وجو، مقایسه و تحلیل کرده و اطلاعات کلیدی درباره‌ی توالی، ساختار ثانویه و موقعیت ژنومی آن‌ها ارائه می‌دهد.

🔷 ‌قابلیت‌های ''miRBase'':
1⃣ جست‌وجوی پیشرفته بر اساس نام، شناسه، گونه یا توالی.
2⃣ مشاهده و دانلود توالی‌های ''mature'' و ''precursor miRNA''.
3⃣ ارائه ''anotations'' دقیق و به‌روز.
4⃣ لینک مستقیم به پایگاه‌هایی مانند ''Ensembl'' ،''NCBI'' و ''Rfam'' برای تحلیل‌های تکمیلی.

❓شما تا حالا از ''miRBase'' برای شناسایی یا طراحی‌ پرایمر ''miRNA'' استفاده کرده‌اید؟ یا برای تحلیل بیان ژنی؟ تجربه‌تون رو با ما به اشتراک بگذارید.

✍🏻 زهرا حنیفه‌زاده

🔗 لینک پایگاه:
https://www.mirbase.org

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

شرکت‌کننده‌ی گرامی دوره‌ی جامع بیوانفورماتیک

🛑 آزمون پایانی دوره، در روز جمعه ٢٨ شهریورماه رأس ساعت ٩:٠٠ صبح آغاز می‌شود.

جزئیات آزمون:
📝 تعداد سوالات: ١٩٠ سوال
⏰ زمان شروع: ٩:٠٠ صبح
⏳ زمان پایان: ١٠:۴۵ صبح
✅ آزمون نمره منفی ندارد

⏱️ شما فقط بین ساعت ٩:٠٠ تا ٩:٢٠ صبح فرصت ورود به آزمون را دارید.
اگر در این بازه وارد شوید، زمان کامل آزمون برای شما لحاظ خواهد شد.
❗پس از ساعت ٩:٢٠ امکان ورود به آزمون وجود ندارد.
‼️با توجه به تعداد بالای شرکت‌کنندگان، پیشنهاد می‌شود از ورود دقیقاً در ساعت ٩ خودداری کرده و ترجیحاً ۲ دقیقه پیش از آغاز آزمون یا چند دقیقه پس از آن وارد سامانه شوید تا از بروز اختلال جلوگیری شود.


🔹 نکته ۱:
اطلاعات مربوط به سایت آزمون، نام کاربری و رمز عبور در اطلاعیه‌ی بعدی اعلام خواهد شد.

🔹 نکته ۲:
آزمون آزمایشی جهت آشنایی شما با سامانه، در روز چهارشنبه و پنجشنبه برگزار می‌شود.
⌛ زمان فعال بودن: از ساعت ۱۲ظهر چهارشنبه الی ۲۰ پنجشنبه
✅ شرکت در این آزمون الزامی است.

🔹 نکته ۳:
در طول آزمون:
به هیچ وجه از صفحه خارج نشوید.
فقط با یک دستگاه و از طریق اینترنت پرسرعت وارد شوید.
⚠️ در صورت رفرش یا خروج از صفحه، پاسخ‌ها ذخیره نمی‌شوند و مسئولیت آن بر عهده داوطلب است.

‼️ نکته بسیار مهم:
داوطلب موظف است پیش از آزمون، سامانه آزمون، نام کاربری و رمز عبور خود را بررسی کرده و در صورت وجود مشکل، به آیدی پشتیبانی زیر پیام دهد.

@biocan_supportt

در غیر این صورت، تمام مسئولیت مشکلات ورود یا عدم آشنایی با سامانه بر عهده‌ی داوطلب خواهد بود.

✨ آموزش مرحله‌به‌مرحله تحلیل بیان ژن با DESeq2 و GEO2R

🌟 یکی از چالش‌های اصلی در RNA-seq، شناسایی ژن‌های با بیان متفاوت بین گروه‌های آزمایشی است. نرم‌افزارهای تخصصی نصب و تنظیمات پیچیده‌ای دارند، اما یک راه ساده‌تر هم وجود دارد.

🧬 پایگاه GEO ابزار قدرتمندی به نام GEO2R در اختیار شما می‌گذارد که تنها با وارد کردن Accession ID و تعریف گروه‌ها، قادر به اجرای آنالیز بیان افتراقی (Differential Expression) خواهید بود.

🚀 در این آموزش مرحله‌به‌مرحله یاد می‌گیرید چطور گروه‌ها را مشخص کنید، نتایج را تحلیل کنید و خروجی‌هایی مانند volcano plot، box plot و جداول ژن‌های تفکیک‌شده را به دست آورید.

📽 بدون نیاز به نصب نرم‌افزار، فقط با مرورگر می‌توانید داده‌های GEO را تحلیل و نتایج استاندارد منتشر کنید.

🔗 source

💿 همراه با زیرنویس تهیه‌شده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠  @ir_bioinf_group

📌ریزتراشه‌های نامرئی، انقلابی در پردازش داده‌ها

🏢 دانشگاه جانز هاپکینز با همکاری محققان بین‌المللی، انقلابی در فناوری ساخت تراشه ایجاد کرده است. آنها با استفاده از مواد جدیدی به نام «فلزات-آلی» و روشی نوآورانه به نام «رسوب‌گذاری شیمیایی مایع»، موفق به تولید ریزتراشه‌هایی شده‌اند که با چشم غیرمسلح قابل دیدن نیستند.

✅ این فناوری مشکل اصلی در ساخت مدارهای بسیار ریز را حل کرده است. در روش‌های فعلی، از لایه‌های حساس به نور روی ویفرهای سیلیکونی استفاده می‌شود که برای ایجاد الگوهای ظریف به پرتوهای نوری بسیار قوی و دقیق نیاز دارند. با کشف فلزات-آلی مانند روی که واکنش بهتری نسبت به پرتوهای فرابنفش شدید (B-EUV) نشان می‌دهند، این محدودیت برطرف شده است.

📈 این پیشرفت چشمگیر، راه را برای تولید نسل بعدی تراشه‌های فوق‌کوچک، قدرتمند و کم‌مصرف هموار می‌کند و تحولی بزرگ در صنایع الکترونیک و محاسباتی ایجاد خواهد کرد.

✍🏻سهیلا سلحشورفرد

💡source

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

وقتی قراره یه آنالیز جدید توی R استودیو رو ران کنی و خطایError: object not found میگیری☠

#bioinformatic_meme

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

✅ سلول‌ها دوباره جان می‌گیرند

💻 ابزاری نوین با کمک هوش مصنوعی طراحی شده که می‌تواند ژن‌ها و ترکیب‌های دارویی مؤثر را شناسایی کرده و به سلول‌های بیمار کمک کند دوباره عملکرد طبیعی خود را به دست آورند.

🔬 این مدل به جای نگاه جداگانه به داده‌ها، ارتباط بین ژن‌ها، پروتئین‌ها و مسیرهای پیام‌رسانی در سلول را بررسی می‌کند و از این راه، ترکیب‌های درمانی مؤثر را پیش‌بینی می‌کند.

🧪 آزمایش‌ها نشان داده‌اند که ابزار نه‌تنها اهداف دارویی شناخته‌شده را شناسایی کرده، بلکه اهداف جدیدی هم معرفی کرده است؛ از جمله KDR/VEGFR2 در سرطان ریه و TOP2A در برخی تومورها. دقت و سرعت این روش از بسیاری از دیگر روش‌های مشابه بالاتر است.

💊 این فناوری می‌تواند فرآیند تولید داروهای تازه را کوتاه‌تر کند، درمان‌هایی ارائه دهد که چند مشکل را هم‌زمان هدف بگیرند و حتی در آینده درمان‌های اختصاصی برای هر بیمار پیشنهاد کند. همچنین، امید می‌رود در درمان بیماری‌های مغزی و عصبی نیز کاربرد داشته باشد.

✍🏻 محمدمهدی آقائی
🔍 روشنک رشیدی
🖌ویراستار:مریم حکمتی

💡source

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

✨ مقایسه ژنوم‌ها با BRIG: تحلیل تصویری شباهت ژنومی

🌟 می‌دانستید می‌توان ژنوم‌های مختلف را به‌صورت تصویری و واضح با هم مقایسه کرد؟

نرم‌افزار BRIG (BLAST Ring Image Generator) این امکان را به شما می‌دهد تا ژنوم‌ها را با یک ژنوم مرجع مقایسه کرده و بخش‌های مشابه یا متفاوت را در قالب حلقه‌های گرافیکی ببینید.

🧬 با BRIG می‌توانید رنگ‌ها و برچسب‌ها را تنظیم کنید و درصد شباهت توالی‌ها (Percentage Identity) را مشخص نمایید. خروجی نرم‌افزار در فرمت‌های تصویری مختلف مثل JPG و SVG قابل ذخیره است، تا تحلیل‌هایتان هم دقیق باشد و هم بصری.

🚀 در این ویدیو، مراحل نصب و آماده‌سازی نرم‌افزار، انتخاب ژنوم‌ها، شخصی‌سازی حلقه‌ها و گرفتن خروجی را گام‌به‌گام یاد می‌گیرید.

🔗 source

💿 همراه با زیرنویس تهیه‌شده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠  @ir_bioinf_group

فقط دو روز دیگر تا وبینار نوآوری‌ها در شناخت و تشخیص آلزایمر از ژن تا میکروبیوم باقی مانده...

سخنرانان:
🔹دکتر شادی زمانیان
متخصص بیماری‌های مغز و اعصاب

🔹دکتر مجید مجرد
متخصص ژنتیک پزشکی

🔹دکتر سپیده حسن‌زاده
متخصص باکتری‌شناسی پزشکی

🕚زمان برگزاری: جمعه ۲۸ شهریور ۱۴۰۴ ساعت ۱۱

🔗لینک ثبت‌نام‌ رایگان

📍Instagram | Linkedin | Support


─━⊱🧬 آکادمی ژنتیک ایران
─━⊱🧬 @ir_Genetics_academy

🏣راه‌اندازی سامانه هوش مصنوعی کشف دارو برای همکاری با شرکت‌های زیست فناوری توسط الی لیلی

✅ شرکت داروسازی بزرگ Eli Lilly با راه‌اندازی سامانه هوش مصنوعی جدیدی به نام (ThionLab)، همکاری با شرکت‌های زیست‌فناوری را متحول کرده است. این پلتفرم به شرکت‌های منتخب اجازه میدهد تا از مدل‌های پیشرفته هوش مصنوعی آموزش‌دیده بر اساس داده‌های داخلی الی‌لیلی، برای تسریع فرآیند کشف دارو استفاده کنند.

⌛️ تاکنون حدود ۱۲ شرکت نوپا به این برنامه پیوسته‌اند و از مدل‌های هوش مصنوعی در مراحل کشف دارو و مطالعات پیش‌بالینی استفاده می‌کنند. این حرکت با سیاست‌های جدید سازمان غذا و داروی آمریکا (FDA) که کاهش آزمایش‌های حیوانی و استفاده از روش‌های مبتنی بر هوش مصنوعی را تشویق می‌کند، همسو است.

💰 پیش‌بینی می‌شود سرمایه‌گذاری در حوزه هوش مصنوعی دارویی تا سال ۲۰۴۰ به ده‌ها میلیارد دلار برسد. این اقدام الی‌لیلی، گامی مهم در جهت دسترسی به فناوری‌های پیشرفته در صنعت داروسازی است.

✍🏻سهیلا سلحشورفرد

💡source

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group