tgoop.com/ir_bioinformtic_academy/1298
Last Update:
🦠 تحلیل پان‌ژنوم باکتری‌ها: مراحل عملی و ابزارها (پارت ۲)
🧬 در این آموزش، روش انجام تحلیل پان‌ژنوم بر روی ژنوم باکتری‌ها تشریح شده است. ابتدا با مفهوم پان‌ژنوم و اهمیت تحلیل آن آشنا می‌شویم و ابزارهای موجود برای انجام این تحلیل معرفی می‌گردند.
🧫 در بخش عملی، نحوه استفاده از نرم‌افزار RURI بررسی شده و پیش‌نیازهای سخت‌افزاری و نرم‌افزاری، از جمله محیط لینوکس و نصب Anaconda، توضیح داده می‌شوند. ژنوم‌ها از پایگاه داده NCBI دانلود شده و با نرم‌افزار Prokka حاشیه‌نویسی می‌شوند تا فایل‌های GFF لازم برای تحلیل پان‌ژنوم ایجاد شوند.
✨ این فرایند امکان شناسایی تنوع ژنومی، ساختار جمعیتی و ژن‌های اختصاصی گونه یا سویه‌ها را فراهم می‌سازد و نتایج حاصل مورد تحلیل و تفسیر قرار می‌گیرند.
🔗 Source
💿 همراه با زیرنویس تهیه‌شده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
BY کانال آکادمی بیوانفورماتیک ایران
Share with your friend now:
tgoop.com/ir_bioinformtic_academy/1298