آکادمی تخصصی علوم پایه ایران

s41597-025-05411-z.pdf

1.7 MB

📘 عنوان مقاله:

A chromosome‑scale genome assembly of the leaf roller, Eumorphobotys obscuralis

نویسندگان:
Shu-Zhen Wang و همکاران

ژورنال:
Scientific Data

تاریخ انتشار : ۲۳ ژوئن ۲۰۲۵

حوزه تخصصی: #ژنتیک، #آفات_کشاورزی، #بیوانفورماتیک
زمان مطالعه: حدود ۲۵ دقیقه

توضیح خلاصه مقاله:

در این پژوهش، برای اولین بار توالی کامل و در مقیاس کروموزومی ژنوم یک گونه‌ی آفت مهم کشاورزی به نام Eumorphobotys obscuralis (نوعی برگ‌پیچ یا Leaf Roller) منتشر شده است.

محققان از سه فناوری پیشرفته برای مونتاژ ژنوم استفاده کردند:
🔹 Illumina short reads
🔹 PacBio HiFi long reads
🔹 Hi-C sequencing

نتایج کلیدی:

حجم کل ژنوم: حدود ۷۰۲ مگابایت

تعداد کروموزوم‌ها: ۳۱ عدد شامل کروموزوم Z (جنسیتی)

شاخص Contig N50: برابر با 1.73 مگابیس

تعداد ژن‌ها: شناسایی بیش از ۱۵٬۸۵۵ ژن کدکننده پروتئین

درصد BUSCO (کیفیت پوشش ژنی): بسیار بالا، نشان‌دهنده دقت خوب مونتاژ

آکادمی تخصصی علوم پایه ایران :
@SAOBSO_IR1

🔥3

www.tgoop.com/SAOBSO_IR1/1572

399 viewsJul 1 at 10:09

📘 عنوان مقاله:

A chromosome‑scale genome assembly of the leaf roller, Eumorphobotys obscuralis

نویسندگان:
Shu-Zhen Wang و همکاران

ژورنال:
Scientific Data

تاریخ انتشار : ۲۳ ژوئن ۲۰۲۵

حوزه تخصصی: #ژنتیک، #آفات_کشاورزی، #بیوانفورماتیک
زمان مطالعه: حدود ۲۵ دقیقه

توضیح خلاصه مقاله:

در این پژوهش، برای اولین بار توالی کامل و در مقیاس کروموزومی ژنوم یک گونه‌ی آفت مهم کشاورزی به نام Eumorphobotys obscuralis (نوعی برگ‌پیچ یا Leaf Roller) منتشر شده است.

محققان از سه فناوری پیشرفته برای مونتاژ ژنوم استفاده کردند:
🔹 Illumina short reads
🔹 PacBio HiFi long reads
🔹 Hi-C sequencing

نتایج کلیدی:

حجم کل ژنوم: حدود ۷۰۲ مگابایت

تعداد کروموزوم‌ها: ۳۱ عدد شامل کروموزوم Z (جنسیتی)

شاخص Contig N50: برابر با 1.73 مگابیس

تعداد ژن‌ها: شناسایی بیش از ۱۵٬۸۵۵ ژن کدکننده پروتئین

درصد BUSCO (کیفیت پوشش ژنی): بسیار بالا، نشان‌دهنده دقت خوب مونتاژ

آکادمی تخصصی علوم پایه ایران :
@SAOBSO_IR1

BY آکادمی تخصصی علوم پایه ایران