Warning: Undefined array key 0 in /var/www/tgoop/function.php on line 65

Warning: Trying to access array offset on value of type null in /var/www/tgoop/function.php on line 65
2288 - Telegram Web
Telegram Web
در این مقاله محققان دانشگاه MIT و استنفورد نشان داده اند که چگونه از هوش مصنوعی می توانید برای انالیز داده های امیکسی استفاده کنید
برای دسترسی به کدهای ارائه شده بر روی این لینک کلیک کنید
برای دسترسی به آموزش های مربوط به این مقاله برای استفاده از ابزارهای معرفی شده بر روی این لینک کلیک کنید
در اپدیت ۲۰۲۵ پایگاه داده retractionwatch لیست تمام برندگان نوبل که دارای حداقل یک مقاله ریترکت شده هستند قید شده است. نفرات اول تا چهارم این لیست عبارتند از؛
۱- Gregg Semenza (13): 2019 Nobel Prize in Physiology or Medicine.
۲- David Baltimore (3): 1975 Nobel Prize in Physiology or Medicine.
۳- Linda B Buck (3): 2004 Nobel Prize in Physiology or Medicine.
۴- Max Planck (2): 1918 Nobel Prize in Physics.

🔵 ادامه لیست...

در این لیست جناب مکس پلانک بزرگ هم حضور دارد و در سال ۱۹۴۲ دو مقاله خود را به دلیل نقض قانون حق مالکیت از دست داده است...
How it works issue 201-2025
این حجم ابزارآلاتی که تو ایران تبلیغات می‌کنند، حتی تو انقلاب صنعتی اروپا و عصر آهن هم مورد نیاز نبوده.😢

اگه متر به متر مملکت رو سوراخ کنی و رول‌پلاک بکنی توش بازم این حجم دریل خیلی اضافه‌ست 😂😂 آخه چرا؟ نکنه ی خبرایی هست ما نمیدونیم😂
معرفی ابزار Figeno
ابزاری کاربردی و ساده برای ترسیم و بصری سازی داده های ژنومی و ایجاد پلات های خارق العاده و زیبا. این ابزار مبتنی بر پایتون است و به راحتی می توانید از طریق دستور pip ان را نصب کنید
دانلود
نصب
pip install figeno
figeno gui
معرفی Plotgardener
یک ابزار کاربردی و حرفه ای مبتنی بر R برای نمایش داده های ژنومی در مقایس بزرگ است. با استفاده از این کتابخانه R می توانید طیف گسترده ای از داده های امیکسی را در شمایل مختلف بصری سازی نمایید.

نصب:
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")

BiocManager::install(version = "3.18")

BiocManager::install("plotgardener")
دانشجویان عزیز، اگرچه ممکن است امروز بازار کار در حوزه بیوتکنولوژی کشاورزی چالش‌های خاص خود را داشته باشد، اما هر چالش در کنار خود فرصت‌های نوآوری و رشد را به همراه می‌آورد. دنیای بیوتکنولوژی به سرعت در حال تغییر و تحول است و هر روز پنجره‌های جدیدی برای ایجاد راه‌حل‌های خلاقانه در بخش کشاورزی باز می‌شود. تلاش و پشتکار شما، نقطه شروعی برای خلق نوآوری‌هایی است که می‌تواند افق‌های تازه‌ای را در این عرصه رقم بزند.

با نگاهی به دستاوردهای علمی و تجربیات موفق پژوهشگران برجسته در سطح جهان، متوجه می‌شویم که مسیر پیشرفت همواره از عبور از موانع شروع شده است. دانش شما در زمینه بیوتکنولوژی، اگر به درستی به کار گرفته شود، می‌تواند منبعی ارزشمند برای تبدیل چالش‌های امروز به فرصت‌های فردا باشد. با استفاده از مهارت‌های تخصصی و تحقیقات نوین، می‌توانید نقش بسزایی در بهبود تولیدات کشاورزی و ایجاد تغییرات مثبت در جامعه ایفا کنید.

فرصت‌های شغلی و درآمدزایی در آینده برای افرادی که همت و پشتکار خود را در مسیر نوآوری قرار می‌دهند، سرشار از وعده‌های بزرگ است. هر قدمی که در مسیر یادگیری و پژوهش برمی‌دارید، شما را به یک متخصص برجسته و فردی تبدیل می‌کند که می‌تواند بازار کار را متحول سازد. همواره به یاد داشته باشید که بدیهی است تغییرات بزرگ از آن کسانی شروع می‌شود که جرأت داشتند متفاوت فکر کنند و از چالش‌ها به عنوان انگیزه‌ای برای پیشرفت استفاده نمایند.
IRBioinformatics.bat
806 B
یکی از مشکلات رایجی که خیلی از پژوهشگران باهاش دست و پنجه نرم می کنند بحث شلوغی فولدرها و نامرتب بودن فایل های موجود در هر فولدر هستش. با استفاده از این افزونه غیر نصبی می توانید به فایل های خود نظم دهید و فایل هایی که به صورت پراکنده در یک درایو دارید یا در پوشه دانلود یا هرجای دیگر براساس فرمت آنها مرتب کنید و به صورت اتوماتیک دسته بندی کنید. کافی است فایل پیوست را دانلود کنید و بر روی آن کلیک کنید تا فایل های شما به صورت اتوماتیک براساس فرمتی که دارند دسته بندی شود. این فایل که با فرمت .bat است در ویندوز مدیریت فایل را برای شما آسان می کند.
مستند آب: مولکولی که ما را ساخت
لینک مشاهده
یه اصطلاح معروف آمریکایی هست که میگه:
Go Big Or Go Home
یعنی:
"یا تا تهش برو، یا کلاً بی‌خیال شو."
اگه یه چیزی رو می‌خوای، باید یا با تمام توان بازی کنی یا از زمین بازی بری بیرون و دیگه حرفشم نزنی.
برای رسیدن به اهدافت تمام شجاعت و خلاقیتت رو بذار وسط، وگرنه این فرصت رو کسی به دست میاره که جرعتش رو داره.
Scotty_McCreery,_Travis_Thrasher_Go_Big_or_Go_Home_The_Journey_Toward.pdf
6.3 MB
Go Big Or Go Home
یعنی:
"یا تا تهش برو، یا کلاً بی‌خیال شو."
دیروز 15 آپریل 2025 در سایت ژورنال نیچر یک گزارش چاپ شده است که در آن به بررسی پراستنادترین مقالات قرن 21 پرداخته است. در پیوست می توانید لیست این مقالات را مشاهده کنید. برای مطالعه بیشتر به این لینک مراجعه کنید.جالب اینجاست که دستاوردهای بزرگ علمی مانند واکسن‌های mRNA، ویرایش ژن مبتنی بر CRISPR، کشف بوزون هیگز و نخستین اندازه‌گیری‌های امواج گرانشی در میان این مقالات پربازدید قرار ندارند.
fastp-master.zip
184.1 KB
نرم افزار fastp یک ابزار همه کاره برای کنترل کیفی داده های NGS
نصب از طریق کوندا:
conda install -c bioconda fastp

اجرا:

#single end reads
fastp -i in.fq -o out.fq
#paired end reads
fastp -i in.R1.fq.gz -I in.R2.fq.gz -o out.R1.fq.gz -O out.R2.fq.gz

‍‍
روش WGCNA
روش WGCNA (Weighted Gene Co-expression Network Analysis) یک تکنیک آماری در بیوانفورماتیک است که برای تحلیل الگوهای بیان ژن به‌صورت شبکه‌ای به‌کار می‌رود. در این روش، ژن‌هایی که الگوی بیان مشابهی در نمونه‌های مختلف دارند، به‌صورت خوشه‌هایی از ژن‌های هم‌بیان (co-expressed) گروه‌بندی می‌شوند. سپس شبکه‌ای وزندار از ژن‌ها ساخته می‌شود که در آن هر گره نماینده یک ژن است و وزن یال‌ها میزان شباهت بیان بین دو ژن را نشان می‌دهد. این تحلیل کمک می‌کند تا ماژول‌هایی از ژن‌ها که با ویژگی‌های فنوتیپی یا بیماری خاصی مرتبط هستند، شناسایی شوند. در نهایت، ژن‌های مرکزی یا "hub genes" در هر ماژول شناسایی می‌شوند که می‌توانند اهداف مناسبی برای مطالعات عملکردی یا درمانی باشند.
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
روش WGCNA روش WGCNA (Weighted Gene Co-expression Network Analysis) یک تکنیک آماری در بیوانفورماتیک است که برای تحلیل الگوهای بیان ژن به‌صورت شبکه‌ای به‌کار می‌رود. در این روش، ژن‌هایی که الگوی بیان مشابهی در نمونه‌های مختلف دارند، به‌صورت خوشه‌هایی از ژن‌های…
co_expression_network-main.zip
14.8 KB
برای انجام انالیز wgcna می توانید از کدهای پایتون پیوست استفاده نمایید. کافی است داده های مورد نیاز را در مسیر اسکریپ ها قرار دهید و سپس در مرحله بعد با تغییر مسیر اسکریپت به محل ذخیره داده های ورودی مانند جدول countها و... داده نمودارهای مربوطه را با استفاده از این اسکریپت ها انالیز کنید.
2025/06/30 13:29:02
Back to Top
HTML Embed Code: