داستان Mycoplasma mycoides JCVI-syn1.0،
🔰 اولین باکتری با ژنوم کاملاً مصنوعی، توسط کریگ ونتر و تیمش در سال ۲۰۱۰ ایجاد شد. این پروژه با توالی‌یابی ژنوم Mycoplasma genitalium در سال ۱۹۹۵ آغاز شد و پس از سال‌ها تحقیق، تیم ونتر موفق به سنتز و انتقال ژنوم مصنوعی به یک سلول گیرنده شدند.
🔰این ژنوم مصنوعی شامل ۱٫۰۷۸ قطعه DNA بود که در مراحل مختلف در سلول‌های مخمر مونتاژ شد. برای تشخیص ژنوم مصنوعی، چهار نشانگر دیجیتالی شامل نام محققان و نقل‌قول‌های معروف به آن اضافه شد.
🔰این دستاورد با هزینه‌ای حدود ۴۰ میلیون دلار، گامی بزرگ در زیست‌شناسی مصنوعی محسوب می‌شود و زمینه را برای ایجاد گونه‌های مصنوعی با کاربردهای خاص در آینده فراهم می‌کند. با این حال، پیامدهای اخلاقی و اجتماعی این علم نیز قابل‌توجه است.
🔰 اولین باکتری با ژنوم کاملاً مصنوعی، توسط کریگ ونتر و تیمش در سال ۲۰۱۰ ایجاد شد. این پروژه با توالی‌یابی ژنوم Mycoplasma genitalium در سال ۱۹۹۵ آغاز شد و پس از سال‌ها تحقیق، تیم ونتر موفق به سنتز و انتقال ژنوم مصنوعی به یک سلول گیرنده شدند.
🔰این ژنوم مصنوعی شامل ۱٫۰۷۸ قطعه DNA بود که در مراحل مختلف در سلول‌های مخمر مونتاژ شد. برای تشخیص ژنوم مصنوعی، چهار نشانگر دیجیتالی شامل نام محققان و نقل‌قول‌های معروف به آن اضافه شد.
🔰این دستاورد با هزینه‌ای حدود ۴۰ میلیون دلار، گامی بزرگ در زیست‌شناسی مصنوعی محسوب می‌شود و زمینه را برای ایجاد گونه‌های مصنوعی با کاربردهای خاص در آینده فراهم می‌کند. با این حال، پیامدهای اخلاقی و اجتماعی این علم نیز قابل‌توجه است.
👍3
در اولین کنفرانس بین‌المللی‌ام، با وجود ترس از سندرم ایمپاستر (احساس تقلبی بودن)، ارائه‌ام با موفقیت انجام شد و تشویق محققان ارشد به من اعتماد به نفس لازم را داد.
این احساس از زمان شکست در دبیرستان با من بود و حتی در دوران دکتری، هنگام کار روی پروژه‌ای در حوزه‌ای جدید، همچنان وجود داشت.
با این حال، در جلسه‌ای برای محققان جوان، دانشمندان برجسته‌ای که مقالاتشان را مطالعه کرده بودم، اعتراف کردند که آن‌ها نیز گاهی احساس تقلبی بودن می‌کنند.
این اعترافات صادقانه باعث شد بفهمم که این احساس تنها مختص من نیست و حتی افراد بسیار موفق نیز با آن دست‌و‌پنجه نرم می‌کنند.
این تجربه دیدگاه من را تغییر داد: سندرم ایمپاستر ممکن است نشانه‌ای از رشد و آگاهی به گستردگی ناشناخته‌ها باشد، نه ضعف یا شکست.....
این احساس از زمان شکست در دبیرستان با من بود و حتی در دوران دکتری، هنگام کار روی پروژه‌ای در حوزه‌ای جدید، همچنان وجود داشت.
با این حال، در جلسه‌ای برای محققان جوان، دانشمندان برجسته‌ای که مقالاتشان را مطالعه کرده بودم، اعتراف کردند که آن‌ها نیز گاهی احساس تقلبی بودن می‌کنند.
این اعترافات صادقانه باعث شد بفهمم که این احساس تنها مختص من نیست و حتی افراد بسیار موفق نیز با آن دست‌و‌پنجه نرم می‌کنند.
این تجربه دیدگاه من را تغییر داد: سندرم ایمپاستر ممکن است نشانه‌ای از رشد و آگاهی به گستردگی ناشناخته‌ها باشد، نه ضعف یا شکست.....
👍5
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
Photo
سندرم ایمپاستر ، یک تجربه روانی است که در آن فرد احساس می‌کند در توانایی‌ها و موفقیت‌های خود تقلب کرده است، حتی اگر شواهد خارجی خلاف این را نشان دهند.
افراد مبتلا به این سندرم اغلب به مهارت‌ها و دستاوردهای خود شک دارند و ترس درونی از افشا شدن به عنوان یک فرد متقلب را تجربه می‌کنند.
این پدیده اگرچه یک اختلال روانی رسمی محسوب نمی‌شود، اما به‌طور گسترده‌ای در محیط‌های کاری و موفقیت‌های حرفه‌ای مورد بحث قرار می‌گیرد
سندرم ایمپاستر با عواملی مانند روان‌رنجوری (نوروتیسیسم)، عزت نفس پایین و کمال‌گرایی مرتبط است و با ویژگی‌های شخصیتی مانند برون‌گرایی، توافق‌پذیری و وجدان‌مندی رابطه منفی دارد. این پدیده می‌تواند منجر به تنش در روابط شخصی شده و مانع از دستیابی افراد به پتانسیل کامل خود در حوزه‌های مورد علاقه‌شان شود.
افراد مبتلا به این سندرم اغلب به مهارت‌ها و دستاوردهای خود شک دارند و ترس درونی از افشا شدن به عنوان یک فرد متقلب را تجربه می‌کنند.
این پدیده اگرچه یک اختلال روانی رسمی محسوب نمی‌شود، اما به‌طور گسترده‌ای در محیط‌های کاری و موفقیت‌های حرفه‌ای مورد بحث قرار می‌گیرد
سندرم ایمپاستر با عواملی مانند روان‌رنجوری (نوروتیسیسم)، عزت نفس پایین و کمال‌گرایی مرتبط است و با ویژگی‌های شخصیتی مانند برون‌گرایی، توافق‌پذیری و وجدان‌مندی رابطه منفی دارد. این پدیده می‌تواند منجر به تنش در روابط شخصی شده و مانع از دستیابی افراد به پتانسیل کامل خود در حوزه‌های مورد علاقه‌شان شود.
👍7🥰1
توانایی تولید محاسباتی ساختارهای پروتئینی جدید و قابل تا شدن می‌تواند به کشفیات زیستی جدید و درمان بیماری‌های لاعلاج منجر شود.
در این پژوهش، یک مدل تولیدی مبتنی بر انتشار (diffusion) ارائه شده است که ساختارهای اصلی پروتئین را با الهام از فرآیند طبیعی تا شدن پروتئین‌ها تولید می‌کند.
در این روش، ساختار پروتئین به‌عنوان دنباله‌ای از زوایا توصیف می‌شود که جهت‌گیری اتم‌های اصلی را نشان می‌دهند و با حذف نویز از یک حالت تصادفی و باز شده، به سمت ساختار پایدار هدایت می‌شوند.
این رویکرد نه تنها فرآیند طبیعی تا شدن پروتئین را تقلید می‌کند، بلکه با استفاده از یک مدل ساده مبتنی بر ترنسفورمر، ساختارهای پروتئینی بسیار واقع‌گرایانه و مشابه پروتئین‌های طبیعی تولید می‌کند.
کدها و مدل‌های آموزش‌دیده این پژوهش به‌صورت متن‌باز منتشر شده‌اند.
در این پژوهش، یک مدل تولیدی مبتنی بر انتشار (diffusion) ارائه شده است که ساختارهای اصلی پروتئین را با الهام از فرآیند طبیعی تا شدن پروتئین‌ها تولید می‌کند.
در این روش، ساختار پروتئین به‌عنوان دنباله‌ای از زوایا توصیف می‌شود که جهت‌گیری اتم‌های اصلی را نشان می‌دهند و با حذف نویز از یک حالت تصادفی و باز شده، به سمت ساختار پایدار هدایت می‌شوند.
این رویکرد نه تنها فرآیند طبیعی تا شدن پروتئین را تقلید می‌کند، بلکه با استفاده از یک مدل ساده مبتنی بر ترنسفورمر، ساختارهای پروتئینی بسیار واقع‌گرایانه و مشابه پروتئین‌های طبیعی تولید می‌کند.
کدها و مدل‌های آموزش‌دیده این پژوهش به‌صورت متن‌باز منتشر شده‌اند.
👍2❤1🥰1
🔰 #کریپتوبیوزیس حالتی از بی‌فعالیتی شدید در پاسخ به شرایط نامساعد محیطی است. در حالت کریپتوبیوزیس، تمام فرآیندهای متابولیک متوقف می‌شوند و این امر از تولیدمثل، رشد و ترمیم جلوگیری می‌کند.
🔰 کریپتوبیوزیس یکی از راهکارهای استراتژیک برخی از موجودات مانند خرس ابی یا گونه Tardigrades برای مقابله با شرایط نامساعد محیطی است که در آن این موجود میکروسکوپی پس از مواجه شدن با شرایط نامساعد شدیدا دهیدراته شده و تمام فعالیت های زیستی خود را متوقف می کند.
🔰پس از مساعد شدن محیط مجددا خرس آبی توانایی برگشت به فعالیت روتین زیستی را دارد که در نوع خود این نوع فعالیت زیستی بی نظیر است.
🔰 کریپتوبیوزیس یکی از راهکارهای استراتژیک برخی از موجودات مانند خرس ابی یا گونه Tardigrades برای مقابله با شرایط نامساعد محیطی است که در آن این موجود میکروسکوپی پس از مواجه شدن با شرایط نامساعد شدیدا دهیدراته شده و تمام فعالیت های زیستی خود را متوقف می کند.
🔰پس از مساعد شدن محیط مجددا خرس آبی توانایی برگشت به فعالیت روتین زیستی را دارد که در نوع خود این نوع فعالیت زیستی بی نظیر است.
👍5👏2
FtypeATP.pdf
808.9 KB
آشنایی با کمپلکس F-type ATPase باکتریایی
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/2051
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/2051
💯2❤1🔥1
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
How AI Cracked the Protein Folding Code and Won a Nobel Prize
@irbioinformatics
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/2052
@irbioinformatics
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/2052
❤2🔥2
معجزه جدید تیم دیوید بیکر، برنده نوبل 2024
دانشمندان مدت‌ها به دنبال طراحی آنزیم‌های کاملاً جدید از پایه بوده‌اند، اما پویایی ساختاری آنزیم‌ها این کار را دشوار کرده است، زیرا بیشتر روش‌های طراحی پروتئین بر ساختارهای ایستا تکیه دارند.
گروه دیوید بیکر در پژوهشی جدید که در Science منتشر شده، روشی برای طراحی محاسباتی سرین هیدرولازها ارائه داده است. این آنزیم‌ها در فرآیندهایی مانند انعقاد خون، گوارش و سیگنال‌دهی عصبی نقش دارند. این پژوهش نه‌تنها امکان طراحی این دسته از آنزیم‌ها را نشان می‌دهد، بلکه راهی برای ساخت سایر پروتئین‌های دینامیک ارائه می‌کند.
دانشمندان مدت‌ها به دنبال طراحی آنزیم‌های کاملاً جدید از پایه بوده‌اند، اما پویایی ساختاری آنزیم‌ها این کار را دشوار کرده است، زیرا بیشتر روش‌های طراحی پروتئین بر ساختارهای ایستا تکیه دارند.
گروه دیوید بیکر در پژوهشی جدید که در Science منتشر شده، روشی برای طراحی محاسباتی سرین هیدرولازها ارائه داده است. این آنزیم‌ها در فرآیندهایی مانند انعقاد خون، گوارش و سیگنال‌دهی عصبی نقش دارند. این پژوهش نه‌تنها امکان طراحی این دسته از آنزیم‌ها را نشان می‌دهد، بلکه راهی برای ساخت سایر پروتئین‌های دینامیک ارائه می‌کند.
👏5👍3
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
ساختار کریستالی اشعه ایکس ذره هسته‌ای کروماتین جزئیات اتمی نحوه چیدمان اکتامر پروتئین های هیستونی و چگونگی سازماندهی ۱۴۶ جفت باز DNA به صورت سوپرهلیکس در اطراف آن را نشان می‌دهد.
تعاملات هیستون/هیستون و هیستون/DNA به تاخوردگی هیستون ها و عناصر ساختاری اضافی که سبب گسترش این الگو می شوند وابسته هستند.
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/2059
تعاملات هیستون/هیستون و هیستون/DNA به تاخوردگی هیستون ها و عناصر ساختاری اضافی که سبب گسترش این الگو می شوند وابسته هستند.
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/2059
❤2🔥2👏1
Les Muses: Taylor
Jackson Mullane
موسیقی بی‌کلام اینجوریه که چشمات رو می‌بندی،
از اول زندگیت شروع می‌کنی به پرواز و تا حال و آینده می‌ری...❤️
از اول زندگیت شروع می‌کنی به پرواز و تا حال و آینده می‌ری...❤️
❤7👍1
📚فراخوان انتخاب شعار سی‌وششمین دوره نمایشگاه بین‌المللی کتاب تهران منتشر شد/جایزه بیست میلیونی برای شعار برگزیده
ستاد برگزاری سی‌وششمین نمایشگاه بین‌المللی کتاب تهران برای انتخاب شعار این رویداد فراخوان داد. در این فراخوان بیست میلیون تومان اعتبار خرید کتاب به عنوان جایزه برای بهترین شعار پیشنهادی درنظر گرفته شده است.
https://ketab.ir/News/31569
ستاد برگزاری سی‌وششمین نمایشگاه بین‌المللی کتاب تهران برای انتخاب شعار این رویداد فراخوان داد. در این فراخوان بیست میلیون تومان اعتبار خرید کتاب به عنوان جایزه برای بهترین شعار پیشنهادی درنظر گرفته شده است.
https://ketab.ir/News/31569
👍3
ادرس های جدید سای هاب برای دانلود مقالات👇👇
🟢Sci-Hub got a Web3 domain!
🟢Sci-Hub is now available on two new domains: sci-hub.red and sci-hub.box
🟢Sci-Hub got a Web3 domain!
🟢Sci-Hub is now available on two new domains: sci-hub.red and sci-hub.box
👍7